[发明专利]用于识别生物样本中的表达区别要素的方法在审

专利信息
申请号: 201880015369.6 申请日: 2018-03-02
公开(公告)号: CN110326051A 公开(公告)日: 2019-10-11
发明(设计)人: L.A.纽伯格;M.扎沃德斯基;C.D.科迪拉 申请(专利权)人: 通用电气公司
主分类号: G16B25/00 分类号: G16B25/00
代理公司: 中国专利代理(香港)有限公司 72001 代理人: 姜冰;杨美灵
地址: 美国*** 国省代码: 美国;US
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摘要: 本技术提供了用于使用包括具有对目标分子的粘合特异性的信号发生器的信号强度的表达数据来确定生物样本的基因表达区别要素的技术。可以分析多个样本以确定可用于识别细胞类型或理解疾病进展机理的基因表达区别要素。
搜索关键词: 基因表达 生物样本 信号发生器 表达数据 疾病进展 目标分子 细胞类型 粘合 可用 样本 分析
【主权项】:
1.一种用于识别表达区别要素的方法,包括:访问生物样本中的两个或更多生物样本的相应表达数据(14),所述表达数据包括对应于相应两个或更多基因的信号强度值;生成所述两个或更多生物样本的表达矩阵(62),所述表达矩阵从每个个体生物样本的所述表达数据(14)的所述信号强度值导出,并且具有代表所述两个或更多基因和生物样本中的所述两个或更多生物样本的维度;从所述表达矩阵生成联合表达矩阵(66),所述联合表达矩阵在所述两个或更多生物样本的所述两个或更多基因中的每两个基因之间具有共表达概率元素;归一化所述联合表达矩阵(66)的行以生成条件表达矩阵(68);基于所述条件表达矩阵(68)的区别行(70)中的行向量的最高量值来识别所述区别行(70);以及提供与所述区别行(70)关联的所述两个或更多基因中的个体基因是用于所述两个或更多生物样本的表达区别要素的指示(步骤56)。
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