[发明专利]用于生物标记识别的系统和方法在审
申请号: | 201880029975.3 | 申请日: | 2018-05-11 |
公开(公告)号: | CN110603597A | 公开(公告)日: | 2019-12-20 |
发明(设计)人: | W·J·耶森 | 申请(专利权)人: | 美国控股实验室公司 |
主分类号: | G16B50/00 | 分类号: | G16B50/00;C12Q1/6886 |
代理公司: | 11038 中国国际贸易促进委员会专利商标事务所 | 代理人: | 周衡威 |
地址: | 美国北*** | 国省代码: | 美国;US |
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摘要: | 本发明涉及用于从关联的且基于知识的系统和处理中识别生物标记的系统和方法。具体地,本发明的各方面针对一种计算机实现的方法,该方法包括:使用查询对生物医学文本、科学摘要或生物信息学数据的一个或多个公共来源进行数据挖掘以识别与一个或多个预定项相关联的数据库项,对识别出的每个数据库项和所述一个或多个预定项之间的(一个或多个)关联进行评分,基于该(一个或多个)关联的得分来确定子集b,按预定次序使用算法的组合来开发包括子集b中的数据库项、相互作用和附加数据库项的相互作用网络模型,以及基于相互作用网络模型中子集b中的数据库项和附加数据库项的排名从相互作用网络模型中识别候选生物标记。 | ||
搜索关键词: | 数据库项 网络模型 关联 生物标记 预定项 子集 计算机实现 生物信息学 生物医学 识别候选 数据挖掘 预定次序 算法 文本 查询 开发 | ||
【主权项】:
1.一种用于识别生物标记的方法,所述方法包括:/n通过计算设备,使用查询对生物医学文本、科学摘要或生物信息学数据的一个或多个公共来源进行数据挖掘,以识别与一个或多个预定项相关联的数据库项;/n通过所述计算设备,对识别出的数据库项中的每个数据库项与所述一个或多个预定项之间的一个或多个关联进行评分;/n通过所述计算设备,基于识别出的数据库项中的每个数据库项与所述一个或多个预定项之间的所述一个或多个关联的得分来确定子集b;/n通过所述计算设备,按预定次序使用算法的组合来开发相互作用网络模型,所述相互作用网络模型包括相互作用、附加数据库项以及所述子集b中的数据库项,其中所述相互作用网络模型是使用包括特定于组织或器官的参数的预设参数来开发的,所述特定于组织或器官的参数将所述相互作用和所述附加数据库项限制到具体的组织或器官;以及/n通过所述计算设备,基于所述相互作用网络模型中的所述附加数据库项以及所述子集b中的数据库项的排名,从所述相互作用网络模型中识别候选生物标记。/n
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