[发明专利]用于检测串联重复区的方法、系统和计算机可读介质在审
申请号: | 201880077507.3 | 申请日: | 2018-11-30 |
公开(公告)号: | CN111433374A | 公开(公告)日: | 2020-07-17 |
发明(设计)人: | D·卡兹那德扎 | 申请(专利权)人: | 生命科技股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869 |
代理公司: | 上海专利商标事务所有限公司 31100 | 代理人: | 周全;陈洁 |
地址: | 美国加利*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | 一种用于检测样品的FLT3基因中的串联重复区的方法,该方法包括将与FLT3基因的外显子的靶向区域相对应的读段映射到参考序列。部分映射的读段包括映射部分、软剪接部分和断点。分析与堆积的列相交的部分映射的读段的步骤包括:通过将所述软剪接部分与和断点相邻的所述映射部分进行比较来检测所述软剪接部分中的重复区;确定在软剪接部分中的重复区的插入片段尺寸;并根据所述插入片段尺寸将所述部分映射的读段归属到类别。类别对应于插入片段尺寸。类别被过滤并转换为对应于该列的特征。合并与表示同一插入片段的一个或多个列相对应的特征,以确定串联重复区的位置和尺寸。 | ||
搜索关键词: | 用于 检测 串联 重复 方法 系统 计算机 可读 介质 | ||
【主权项】:
暂无信息
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