[发明专利]一种基于高通量测序检测丛枝菌根真菌的引物及检测方法有效
| 申请号： | 201910024614.6 | 申请日： | 2019-01-10 |
| 公开（公告）号： | CN109680091B | 公开（公告）日： | 2022-04-19 |
| 发明（设计）人： | 王启;刘广达 | 申请（专利权）人： | 内蒙古科技大学包头医学院 |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895;C12N15/11 |
| 代理公司： | 暂无信息 | 代理人： | 暂无信息 |
| 地址： | 014000 内蒙古*** | 国省代码： | 内蒙古;15 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种基于高通量测序检测丛枝菌根真菌的引物及检测方法，包括以下步骤：以待测植物或土壤样本的基因组DNA为模板，由引物一和引物二连接高通量测序通用引物接头后进行PCR扩增，PCR扩增产物纯化后进行高通量测序，将测得的原始序列经过处理得到Cleandata序列，与具有明确注释信息的丛枝菌根真菌28SrRNA参照序列相应的区域进行Blast比对，通过设置比对的相似度和覆盖率，筛选出与参照序列具有较高相似度的序列等；本方法可以灵敏地检测出土壤样本中的丛枝菌根真菌孢子和植物中的丛枝菌根真菌菌丝体，并可以使丛枝菌根真菌在属的水平上得到更好的注释，既可以进行定性分析也可以进行相对定量分析。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 通量 检测 菌根 真菌 引物 方法 | ||
【主权项】：
1.一种基于高通量测序检测丛枝菌根真菌的引物对，其特征在于，引物序列如下：引物一：5’‑CCGCTGAACTTAAGCATATC‑3’；引物二：5’‑AGCTGCAWTCCCAAACAACT‑3’。
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