[发明专利]一种TaqMan-MGB探针技术检测影响降脂药物疗效基因的方法学建立

摘要

本发明公开了一种TaqMan‑MGB探针实时荧光定量PCR技术联合检测影响降脂药物疗效基因的方法，检测待测样本中影响降脂药物疗效基因的多态性，本发明同够时检测六个SNP位点，使用的引物和TaqMan‑MGB探针特异性强，可降低PCR产物污染引起假阳性的风险操，操作简单、结果准确可靠，本发明通过检测SLCO1B1 c.521T＞C(rs4149056)、SLCO1B1 c.388A＞G(rs2302683)、SLCO1B1 c.‑910G＞A(rs4149015)、ApoE c.388T＞C(rs429358)、ApoE c.526C＞T(rs7412)和NPC1L1 c.‑18C＞A(rs41279633)这些有功能意义的突变可辅助临床医生选择合适的药物和剂量，或者避免药物相互作用的发生，使病人得到最佳的治疗效果，从而达到真正“用药个体化”的目的。

主权项

1.一种检测影响降脂药物疗效基因突变用的引物、TaqMan/MGB探针，其特征在于，引物探针的序列如下：1)用于SLCO1B1基因T521C SNP位点检测的引物和TaqMan/MGB探针：上游引物：5’‑AAAGGAATCTGGGTCATAC‑3’，下游引物：5’‑CCTATTCCACGAAGCATA‑3’，野生探针：5’‑FAM‑CCATGAACACATATA‑MGB‑3’，突变探针：5’‑HEX‑CATGAACGCATATA‑MGB‑3’；2)用于SLCO1B1基因A388G SNP位点检测的引物和TaqMan/MGB探针：上游引物：5’‑TTGATTAATTAAACAAGT‑3’，下游引物：5’‑TCAGTGATGTTCTTACAG‑3’，野生探针：5’‑FAM‑ATGAATTGATATTAG‑MGB‑3’，突变探针：5’‑HEX‑ATGAATCGATATTAG‑MGB‑3’；3)用于SLCO1B1基因G910A SNP位点检测的引物和TaqMan/MGB探针：上游引物：5’‑CTCATATATGCATCCTC‑3’，下游引物：5’‑TATATACACACAAACAT‑3’，野生探针：5’‑FAM‑TGTATACAGGTAAA‑MGB‑3’，突变探针：5’‑HEX‑TGTATACAGGTAAA‑MGB‑3’；4)用于ApoE基因T388C SNP位点检测的引物和TaqMan/MGB探针：上游引物：5’‑CTGTCCAAGGAGCTG‑3’，下游引物：5’‑CCGCGCACGTCCT‑3’，野生探针：5’‑FAM‑CCGCACACGTCCT‑MGB‑3’，突变探针：5’‑HEX‑CCGCGCACGTCCT‑MGB‑3’；5)用于ApoE基因C526T SNP位点检测的引物和TaqMan/MGB探针：上游引物：5’‑CCTCGCCTCCCACC‑3’，下游引物：5’‑CCCGGCCTGGTAC‑3’，野生探针：5’‑FAM‑TGCCAGGCGCTTC‑MGB‑3’，突变探针：5’‑HEX‑TGCCAGGCACTTC‑MGB‑3’；6)用于NPC1L1基因C18A SNP位点检测的引物和TaqMan/MGB探针：上游引物：5’‑TCACCAAGCGCAGGAG‑3’，下游引物：5’‑CTGCCTTAATGTGTGTTCA‑3’，野生探针：5’‑FAM‑CGCTGAGCCCTTC‑MGB‑3’，突变探针：5’‑HEX‑CGCTGATCCCTTC‑MGB‑3’。