[发明专利]用于菜豆种质资源鉴定的SNP标记及其筛选方法在审
| 申请号： | 201910093795.8 | 申请日： | 2019-01-30 |
| 公开（公告）号： | CN109762922A | 公开（公告）日： | 2019-05-17 |
| 发明（设计）人： | 颜廷进;丁汉凤;蒲艳艳;李群;张文兰;田茜;戴双;邓翠霞 | 申请（专利权）人： | 山东省农作物种质资源中心 |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895;C12N15/11;G16B20/20;G16B30/00 |
| 代理公司： | 济南诚智商标专利事务所有限公司 37105 | 代理人： | 韩百翠 |
| 地址： | 250101 山东*** | 国省代码： | 山东;37 |
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| 摘要： | 本发明公开了用于菜豆种质资源鉴定的SNP标记及其筛选方法，以200份菜豆种质资源材料为研究对象，采用IIB‑RAD技术，利用标准型5'‑NNN‑3'接头与酶切标签连接，文库质控合格后在Illumina Hiseq Xten平台进行双端测序，以期筛选出适合鉴别200份菜豆种质资源所需最少的SNP位点组合，为菜豆种质资源高通量鉴别技术体系的建立提供技术支撑。SNP标记数量大基因组覆盖率高，分型操作简单准确度高，在不同环境下可形成统一标准，SNP与SSR相比，其在品种真实性鉴定和数据库构建方面更有优势。SNP在基因组中密度更高更均匀，更容易实现数据整合比较，更高通量。 | ||
| 搜索关键词： | 菜豆 种质资源 种质资源鉴定 高通量 基因组 筛选 鉴别 品种真实性 数据库构建 标签连接 技术体系 技术支撑 数据整合 统一标准 研究对象 准确度 标准型 测序 分型 酶切 双端 质控 文库 覆盖率 | ||
【主权项】：
1.用于菜豆种质资源鉴定的一组SNP位点，其特征在于，所述SNP位点如下：SNP1位点为染色体NC_023749.1上第46683位脱氧核糖核苷酸；SNP2位点为染色体NC_023749.1上第1017737位脱氧核糖核苷酸；SNP3位点为染色体NC_023749.1上第1086014位脱氧核糖核苷酸；SNP4位点为染色体NC_023749.1上第1254713位脱氧核糖核苷酸；SNP5位点为染色体NC_023749.1上第1311225位脱氧核糖核苷酸；SNP6位点为染色体NC_023749.1上第2131483位脱氧核糖核苷酸；SNP7位点为染色体NC_023749.1上第3007865位脱氧核糖核苷酸；SNP8位点为染色体NC_023749.1上第3135424位脱氧核糖核苷酸；SNP9位点为染色体NC_023749.1上第3923914位脱氧核糖核苷酸；SNP10位点为染色体NC_023749.1上第4942315位脱氧核糖核苷酸；SNP11位点为染色体NC_023749.1上第5432345位脱氧核糖核苷酸；SNP12位点为染色体NC_023749.1上第6522078位脱氧核糖核苷酸；SNP13位点为染色体NC_023749.1上第6620054位脱氧核糖核苷酸；SNP14位点为染色体NC_023749.1上第7722620位脱氧核糖核苷酸；SNP15位点为染色体NC_023749.1上第12162033位脱氧核糖核苷酸；SNP16位点为染色体NC_023749.1上第26664238位脱氧核糖核苷酸；SNP17位点为染色体NC_023750.1上第168481位脱氧核糖核苷酸；SNP18位点为染色体NC_023750.1上第890411位脱氧核糖核苷酸；SNP19位点为染色体NC_023750.1上第4491604位脱氧核糖核苷酸；SNP20位点为染色体NC_023750.1上第30328074位脱氧核糖核苷酸；SNP21位点为染色体NC_023750.1上第42337957位脱氧核糖核苷酸；SNP22位点为染色体NC_023751.1上第3674063位脱氧核糖核苷酸；SNP23位点为染色体NC_023751.1上第28221712位脱氧核糖核苷酸；SNP24位点为染色体NC_023751.1上第36187449位脱氧核糖核苷酸；SNP25位点为染色体NC_023752.1上第7900898位脱氧核糖核苷酸；SNP26位点为染色体NC_023752.1上第28047209位脱氧核糖核苷酸；SNP27位点为染色体NC_023752.1上第35763840位脱氧核糖核苷酸；SNP28位点为染色体NC_023752.1上第44269374位脱氧核糖核苷酸；SNP29位点为染色体NC_023753.1上第17327453位脱氧核糖核苷酸；SNP30位点为染色体NC_023754.1上第1206438位脱氧核糖核苷酸；SNP31位点为染色体NC_023755.1上第11184227位脱氧核糖核苷酸；SNP32位点为染色体NC_023756.1上第22706619位脱氧核糖核苷酸；SNP33位点为染色体NC_023756.1上第34249539位脱氧核糖核苷酸；SNP34位点为染色体NC_023757.1上第13974494位脱氧核糖核苷酸；SNP35位点为染色体NC_023757.1上第18532434位脱氧核糖核苷酸；SNP36位点为染色体NC_023757.1上第19472651位脱氧核糖核苷酸；SNP37位点为染色体NC_023757.1上第24331691位脱氧核糖核苷酸；SNP38位点为染色体NC_023757.1上第27358347位脱氧核糖核苷酸；SNP39位点为染色体NC_023757.1上第43130693位脱氧核糖核苷酸；SNP40位点为染色体NC_023758.1上第8716636位脱氧核糖核苷酸；SNP41位点为染色体NC_023758.1上第8945758位脱氧核糖核苷酸；SNP42位点为染色体NC_023758.1上第21880092位脱氧核糖核苷酸；SNP43位点为染色体NC_023758.1上第46446342位脱氧核糖核苷酸；SNP44位点为染色体NC_023758.1上第48062570位脱氧核糖核苷酸；SNP45位点为染色体NC_023759.1上第10896730位脱氧核糖核苷酸；SNP46位点为染色体NC_023759.1上第16082599位脱氧核糖核苷酸；SNP47位点为染色体NC_023759.1上第37515677位脱氧核糖核苷酸。
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