[发明专利]一种基因型校正的装置和方法有效
申请号: | 201910119729.3 | 申请日: | 2019-02-18 |
公开(公告)号: | CN109785899B | 公开(公告)日: | 2020-01-07 |
发明(设计)人: | 黄铨飞;吕来灰;朱鹏远;王杨 | 申请(专利权)人: | 东莞博奥木华基因科技有限公司 |
主分类号: | G16B5/20 | 分类号: | G16B5/20;G16B20/00 |
代理公司: | 11332 北京品源专利代理有限公司 | 代理人: | 巩克栋 |
地址: | 523808 广东省东莞市东莞松山湖高新*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本发明提供了一种基因型校正的装置和方法,所述装置通过贝叶斯模型对检测到的数据建立统计模型,构建先验分布,确定总体分布信息,并最终计算出后验概率值P(GT|AF),通过判定后验概率值与其对应的阈值关系来对该位点的基因型进行判别,敏感性和特异性好,值得推广应用。 | ||
搜索关键词: | 基因型 后验概率 校正 贝叶斯模型 分布信息 数据建立 统计模型 先验分布 阈值关系 构建 位点 判定 检测 | ||
【主权项】:
1.一种基因型校正的装置,其特征在于,所述装置包括如下单元:/n(1)样本收集单元:收集不同基因型的初始样本,确定初始样本各位点的基因型;/n(2)数据采集单元:对初始样本进行测序和变异分析,采集突变频率;/n(3)模型构建单元:采用贝叶斯模型结合核密度估计的方法,根据单元(2)采集的突变频率和单元(1)确定的已知基因型构建贝叶斯模型,制定阈值;/n所述贝叶斯模型的公式为:/n
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