[发明专利]一种CYP3A5基因rs776746位点多态性核酸质谱检测方法在审

专利信息
申请号: 201910137670.0 申请日: 2019-02-25
公开(公告)号: CN109652514A 公开(公告)日: 2019-04-19
发明(设计)人: 田彦捷;武会娟;马凯;刘旭;程湛;魏颖;朱博兰;朱瑞雪;怀雪飞;傅莹茜;张志超;梁丹丹 申请(专利权)人: 北京市理化分析测试中心;北京北基医学检验实验室有限公司
主分类号: C12Q1/6858 分类号: C12Q1/6858
代理公司: 北京高沃律师事务所 11569 代理人: 刘奇
地址: 100000 北京市*** 国省代码: 北京;11
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摘要: 发明提供了一种CYP3A5基因rs776746位点多态性核酸质谱检测方法,属于单核苷酸多态性检测技术领域,所述方法包括以下步骤:1)以人基因组DNA为模板,用CYP3A5基因rs776746位点引物进行PCR扩增获得扩增产物;2)利用虾碱性磷酸酶对步骤1)中获得的扩增产物进行去磷酸化处理,获得去磷酸化的线性DNA片段;3)对步骤2)中获得的去磷酸化的线性DNA片段进行单碱基延伸获得延伸产物;4)采用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱法检测步骤3)中所述延伸产物,获得所述CYP3A5基因rs776746位点的多态性分型结果。所述检测方法准确、高效、快速。
搜索关键词: 去磷酸化 线性DNA片段 位点多态性 扩增产物 延伸产物 质谱检测 核酸 位点 基质辅助激光解析电离 单核苷酸多态性检测 飞行时间质谱法 虾碱性磷酸酶 人基因组DNA 单碱基延伸 多态性分型 检测 引物
【主权项】:
1.一种CYP3A5基因rs776746位点多态性核酸质谱检测方法,包括以下步骤:1)以人基因组DNA为模板,用CYP3A5基因rs776746位点引物进行PCR扩增获得扩增产物;2)利用虾碱性磷酸酶对步骤1)中获得的扩增产物进行去磷酸化处理,获得去磷酸化的线性DNA片段;3)对步骤2)中获得的去磷酸化的线性DNA片段进行单碱基延伸获得延伸产物;4)采用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱法检测步骤3)中所述延伸产物,获得所述CYP3A5基因rs776746位点的多态性分型结果;步骤1)中所述rs776746位点引物包括rs776746‑F和rs776746‑R;所述rs776746‑F具有如SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列;所述rs776746‑R具有如SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列;步骤3)中所述单碱基延伸的延伸引物为rs776746‑E,具有如SEQ ID NO:3所示的核苷酸序列。
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