[发明专利]细胞信号通路网络特征的确定方法、装置、设备及介质有效
| 申请号： | 201910158480.7 | 申请日： | 2019-03-04 |
| 公开（公告）号： | CN109886385B | 公开（公告）日： | 2019-09-20 |
| 发明（设计）人： | 高军晖;江荣峰;张英霞;龚建兵;林斯;袁卫兰;王丽君;林灵 | 申请（专利权）人： | 上海宝藤生物医药科技股份有限公司;上海宝藤医学检验所有限公司 |
| 主分类号： | G06N3/00 | 分类号： | G06N3/00 |
| 代理公司： | 北京品源专利代理有限公司 11332 | 代理人： | 孟金喆 |
| 地址： | 201203 上海市浦东新区中国*** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种细胞信号通路网络特征的确定方法、装置、设备及介质。该方法包括：获取指定细胞信号通路的完整网络图；根据对应的突变基因集合确定与全部样本匹配的未突变基因交集，突变基因集合与指定细胞信号通路关联；根据完整网络图以及各样本的突变基因集合，计算各样本的未突变基因网络图，生成各未突变基因网络图的节点序列集；使用节点序列集形成语料库，训练得到针对未突变基因交集的词向量模型，并根据各词向量模型对未突变基因交集的处理结果，得到各样本针对指定细胞信号通路的细胞信号通路网络特征。本发明实施例提出了一种全新的，通过样本的基因突变数据描述样本针对指定细胞信号通路的细胞信号通路网络特征的新方式。 | ||
| 搜索关键词： | 细胞信号通路 突变基因 样本 网络图 网络特征 交集 节点序列 词向量 集合 基因突变 集合确定 数据描述 语料库 匹配 关联 | ||
【主权项】：
1.一种细胞信号通路网络特征的确定方法，其特征在于，包括：获取指定细胞信号通路的完整网络图，所述完整网络图包括：多个节点，及连接具有相互作用关系的两个节点的有向边，所述节点包括：基因或化合物；获取多个样本，并根据与各所述样本对应的突变基因集合，确定与全部样本匹配的未突变基因交集，所述突变基因集合与所述指定细胞信号通路关联；根据所述完整网络图以及各所述样本的突变基因集合，计算与各所述样本对应的未突变基因网络图，并生成各所述未突变基因网络图的节点序列集；针对每一个样本，获取与样本对应的节点序列集，将节点序列集中的每个节点序列作为一个句子，加入至与节点序列集对应的语料库中，使用语料库中包括的各个句子，对预设的标准词向量模型进行训练，得到各所述样本针对所述未突变基因交集的词向量模型，并根据各所述样本的词向量模型对所述未突变基因交集的处理结果，得到各所述样本针对所述指定细胞信号通路的细胞信号通路网络特征。
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