[发明专利]蛋白质与药物结合自由能的计算方法、系统、设备及介质有效
申请号: | 201910167720.X | 申请日: | 2019-03-06 |
公开(公告)号: | CN110047559B | 公开(公告)日: | 2021-06-25 |
发明(设计)人: | 段莉莉;黄开放;从亚龙;李皓;钟素素;董淑衡 | 申请(专利权)人: | 山东师范大学 |
主分类号: | G16B20/00 | 分类号: | G16B20/00 |
代理公司: | 济南圣达知识产权代理有限公司 37221 | 代理人: | 黄海丽 |
地址: | 250358 山东省*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | 本公开公开了蛋白质与药物结合自由能的计算方法、系统、设备及介质,构建蛋白质与药物的结合自由能的函数,所述蛋白质与药物结合自由能的函数为蛋白质与药物复合物的结合自由能与静电项、极性溶剂化能项、范德华项、非极性溶剂化能和相互作用熵的函数关系;采集训练集中每个蛋白质与药物复合物的各能项,利用训练集中每个蛋白质与药物复合物的各能量项和每个蛋白质与药物的实验值,对蛋白质与药物的结合自由能的函数的进行多元线性拟合,得到蛋白质与药物的结合自由能的函数;将待测试的蛋白质与药物复合物各能量项输入到训练好的蛋白质与药物的结合自由能的函数中,输出蛋白质与药物的结合自由能。 | ||
搜索关键词: | 蛋白质 药物 结合 自由能 计算方法 系统 设备 介质 | ||
【主权项】:
1.蛋白质与药物结合自由能计算方法,其特征是,包括:构建蛋白质与药物的结合自由能的函数,所述蛋白质与药物结合自由能的函数为蛋白质与药物复合物的结合自由能与静电项、极性溶剂化能项、范德华项、非极性溶剂化能和相互作用熵的函数关系;采集训练集中每个蛋白质与药物复合物的各能项,各能量项包括:静电项、极性溶剂化能项、范德华项、非极性溶剂化能和相互作用熵;利用训练集中每个蛋白质与药物复合物的各能量项和每个蛋白质与药物的实验值,对蛋白质与药物的结合自由能的函数的进行多元线性拟合,得到蛋白质与药物的结合自由能的函数;将待计算的蛋白质与药物复合物的静电项、极性溶剂化能项、范德华项、非极性溶剂化能和相互作用熵输入到拟合得到的蛋白质与药物的结合自由能的函数中,输出蛋白质与药物的结合自由能。
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