[发明专利]一种基因序列比对滤波加速处理方法、系统及装置有效

专利信息
申请号: 201910168053.7 申请日: 2019-03-06
公开(公告)号: CN109887547B 公开(公告)日: 2020-10-02
发明(设计)人: 崔星辰;史宏志;赵健;尹云峰 申请(专利权)人: 苏州浪潮智能科技有限公司
主分类号: G16B30/10 分类号: G16B30/10;G16B25/00
代理公司: 北京集佳知识产权代理有限公司 11227 代理人: 罗满
地址: 215100 江苏省苏州市吴*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明公开了一种基因序列比对滤波加速处理方法、系统及装置,包括:在基因序列匹配的过程中,分别统计待比对序列所包含的seeds在各参考序列子片段的匹配命中次数;按照匹配命中次数的大小对各参考序列子片段进行排序;根据预设阈值设定规则设定滤波阈值,并舍弃匹配命中次数小于滤波阈值的参考序列子片段,以将seeds与未舍弃的参考序列子片段进行基因序列比对。可见,本申请将匹配命中次数较少的参考序列子片段舍弃,从而尽可能多地过滤掉无效匹配位置,进而提高了后续比对效率,减轻了基因序列比对工作的负担。
搜索关键词: 一种 基因 序列 滤波 加速 处理 方法 系统 装置
【主权项】:
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