[发明专利]黄麻中耐盐性状的分子标记及其应用

摘要

本发明涉及植物育种技术领域，具体而言，涉及一种黄麻中耐盐性状的分子标记及其应用。其该SNP位点存在于黄麻基因组中，与影响黄麻耐盐性状的QTL连锁，因而能够用于黄麻耐盐性状的相关研究。本发明提供的SNP位点能够应用于黄麻耐盐品种的培育中，还可以用于种群遗传结构和遗传变异水平等方面的研究。

主权项

1.一种鉴定和/或选择显示新赋予的或增强的耐盐抗性的黄麻植物的方法，其特征在于，包括：a.在所述黄麻植物的DNA中检测mk6160SNP位点、mk5633SNP位点、mk6484SNP位点、mk6723SNP位点、mk7047SNP位点中的至少一种的存在；以及b.选择具有与新赋予的或增强的耐盐抗性相关的所述等位基因的所述黄麻植物；其中所述mk6160SNP位点标记所在Scaffold编号为AWUE01014572.1，在Scaffold上的位置为75788位，参考序列的碱基为C，变异的碱基为T；所述mk5633SNP位点标记所在Scaffold编号为AWUE01017764.1，在Scaffold上的位置为367位，参考序列的碱基为G，变异的碱基为A；所述mk6484SNP位点标记所在Scaffold编号为AWUE01014576.1，在Scaffold上的位置为11416位，参考序列的碱基为G，变异的碱基为A；所述mk6723SNP位点标记所在Scaffold编号为AWUE01014578.1，在Scaffold上的位置为28342位，参考序列的碱基为T，变异的碱基为G；所述mk7047SNP位点标记所在Scaffold编号为AWUE01014583.1，在Scaffold上的位置为47766位，参考序列的碱基为G，变异的碱基为T；优选的，所述检测mk6160SNP位点、mk5633SNP、mk6484SNP位点、mk6723SNP位点、mk7047SNP位点位点的存在的方法为PCR扩增或测序；优选的，所述PCR扩增mk6160SNP位点、mk6484SNP位点、mk5633SNP位点所用上下游引物的核苷酸序列分别如SEQ ID NO：1和2、SEQ ID NO：3和4、SEQ ID NO：5和6所示。