[发明专利]利用芯片合成寡核苷酸文库进行DNA洗牌文库从头合成的方法有效

专利信息
申请号: 201910215880.7 申请日: 2019-03-21
公开(公告)号: CN109868271B 公开(公告)日: 2020-10-30
发明(设计)人: 宛雯;洪泂 申请(专利权)人: 江苏师范大学
主分类号: C12N15/10 分类号: C12N15/10;C40B50/06
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 221000 江*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 利用芯片合成寡核苷酸文库进行DNA洗牌文库从头合成的方法,主要包括:结合比对软件进行亲本序列切割成寡核苷酸序列;利用错配结合蛋白MutS固定化纤维素柱进行寡核苷酸文库的高通量纠错;使用切割后的寡核苷酸进行全长重组文库组装。本发明的方法与现有的方法相比,重组率高,降低了组装成为全长基因序列的难度,并降低了合成成本,提高了序列的多样性,oligo pool的准确性,合成基因文库的保真性和重组的概率。
搜索关键词: 利用 芯片 合成 寡核苷酸 文库 进行 dna 洗牌 从头 方法
【主权项】:
1.利用芯片合成寡核苷酸文库进行DNA洗牌文库从头合成的方法,其特征在于,包括以下步骤:S1:选择具有特定功能的蛋白基因序列,比对这些序列,寻找同源区域,在同源区域进行交错切割,将模板基因序列双链设计成具有同源末端的寡核苷酸片段oligo,实现将全长基因序列在互补区域末端交错切割成较短的寡核苷酸文库oligo pool,再使用DNA芯片合成该oligo pool。S2:使用固定化有错配识别蛋白MutS的纤维素凝胶柱进行oligo pool的错误移除;S3:将错误移除的oligo文库通过基于连接酶的组装方法组装成为全长重组文库。
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