[发明专利]检测黄牛lncFAM200B基因5’侧翼区单核苷酸多态性的方法及其应用有效
申请号: | 201910218571.5 | 申请日: | 2019-03-21 |
公开(公告)号: | CN110172516B | 公开(公告)日: | 2022-05-17 |
发明(设计)人: | 张思欢;蓝贤勇;杜书增;潘传英;黄永震;党瑞华;雷初朝;陈宏 | 申请(专利权)人: | 西北农林科技大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6869 |
代理公司: | 西安通大专利代理有限责任公司 61200 | 代理人: | 范巍 |
地址: | 712100 陕*** | 国省代码: | 陕西;61 |
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摘要: | 本发明公开了一种检测黄牛lncFAM200B基因5'侧翼区单核苷酸多态性的方法及其应用,以中国地方黄牛全基因组DNA为模板,PCR扩增黄牛lncFAM200B基因5'侧翼区序列,再对PCR扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳和DNA测序;根据测序结果鉴定黄牛lncFAM200B基因5'侧翼区的2个单核苷酸变异;关联分析发现lncFAM200B基因5'侧翼区的这2个单核苷酸位点对生长性状具有重要调控,可作为分子标记。本发明提供的检测方法为建立lncFAM200B基因SNP与生长性状关系提供简单、快速的途径,检测结果可用于生长性状的标记辅助选择,加快建立遗传资源优良的黄牛种群。 | ||
搜索关键词: | 检测 黄牛 lncfam200b 基因 侧翼 核苷酸 多态性 方法 及其 应用 | ||
【主权项】:
1.一种检测黄牛lncFAM200B基因5'侧翼区单核苷酸多态性的方法,其特征在于:包括以下步骤:以待测黄牛全基因组DNA为模板,通过PCR扩增黄牛lncFAM200B基因5'侧翼区部分片段,对PCR的扩增产物进行电泳,对电泳条带大小与所述部分片段匹配的PCR产物进行DNA测序;根据测序结果鉴定黄牛lncFAM200B基因5'侧翼区内的两个位点SNP1和SNP2的基因型,其中,SNP1为定位于参考序列NC_037333.1:g.110851366的SNP位点,SNP2为定位于参考序列NC_037333.1:g.110851618的SNP位点。
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