[发明专利]一种单细胞免疫组库测序数据的分析方法有效
| 申请号： | 201910246761.8 | 申请日： | 2019-03-28 |
| 公开（公告）号： | CN109979528B | 公开（公告）日： | 2021-06-25 |
| 发明（设计）人： | 周煌凯;夏昊强;高川;张羽;陶勇;罗玥;邢燕;曾川川 | 申请（专利权）人： | 广州基迪奥生物科技有限公司 |
| 主分类号： | G16B20/00 | 分类号： | G16B20/00;G16B30/00 |
| 代理公司： | 广州三环专利商标代理有限公司 44202 | 代理人： | 颜希文;宋静娜 |
| 地址： | 510000 广东省广州市广州国*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种单细胞免疫组库测序数据的分析方法，包括如下步骤：步骤S1，原始数据进行数据质量统计与基本质控；步骤S2,对步骤S1所得的高质量的reads与参考V(D)J fragments序列进行序列比对及注释，得到Consensus序列；步骤S3，对步骤S2拼接得到的Consensus中的CDR3氨基酸序列进行Clonotype分型分型；步骤S4，对步骤S3所得样本中的Clonotype进行CDR3、V/J基因、V‑J paired特征分析；步骤S5，将不同样本中的clonotype进行合并，然后进行多样本分析。该方法分析流程完整，内容丰富，结果能够可视化展示，能够全面揭示免疫组库信息，从而使用户能够全面了解评估免疫组库状况，可以更精确地反应生物体内的免疫功能。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 单细胞 免疫 组库测 序数 分析 方法 | ||
【主权项】：
1.一种单细胞免疫组库测序数据的分析方法，其特征在于，包括如下步骤：步骤S1，对测序仪产生的T/B淋巴细胞基因组序列数据进行数据质量统计与基本质控，以去除含有测序接头、含有未知碱基及低质量的Reads,筛选出高质量的UMI和高质量的Barcode，得到高质量的reads；步骤S2,对步骤S1所得的高质量的reads与参考V(D)J fragments序列进行序列比对及注释，得到Consensus序列(一致序列)；步骤S3，对步骤S2拼接得到的Consensus中的CDR3氨基酸序列进行Clonotype分型(克隆亚型)分型；步骤S4，对步骤S3所得样本中的Clonotype进行CDR3、V/J基因、V‑J paired特征分析；步骤S5，将不同样本中的clonotype进行合并，然后进行多样本分析。
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