[发明专利]一种高效的一步组装多个基因片段的方法在审

专利信息
申请号: 201910309234.7 申请日: 2019-04-17
公开(公告)号: CN110029101A 公开(公告)日: 2019-07-19
发明(设计)人: 雍金贵;喻明军 申请(专利权)人: 通用生物系统(安徽)有限公司
主分类号: C12N15/10 分类号: C12N15/10
代理公司: 北京和信华成知识产权代理事务所(普通合伙) 11390 代理人: 胡剑辉
地址: 239000 安徽*** 国省代码: 安徽;34
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摘要: 发明公开了一种高效的一步组装多个基因片段的方法,包括overlap PCR—Gibson同源重组步骤,具体步骤为:用片段A和片段B作为模板,将片段A和片段B等摩尔数加入,总量不超过100ng,引物只加入upper1和lower2,其他组分不变,首先设置温度梯度摸索合适的退火温度,然后用合适的退火温度进行PCR扩增,电泳观察后测序检测序列是否正确,获得纯的大片段PCR,先通过特异性引物的overlap PCR获得较纯的大片段PCR,再通过Gibson组装到目标载体,获得基因全长。本发明相较常规的PCR拼接,PCR产物特异性更强,产量更高,更适合做后续的Gibson组装应用该方法可大大缩短3k‑8k的大基因合成的时间,只需要一轮时间,并且该方法很稳定,适合于大规模基因合成和自动化。
搜索关键词: 组装 退火 多个基因 基因合成 特异性引物 大片 测序检测 电泳观察 基因全长 目标载体 同源重组 温度梯度 常规的 摩尔数 引物 拼接 自动化 应用
【主权项】:
1.一种高效的一步组装多个基因片段的方法,其特征在于,包括overlap PCR—Gibson同源重组步骤,具体步骤如下:步骤(1)overlap PCR:第一轮PCR:分别用引物对upper1和lower1、upper2和lower2对目标待融合片段进行PCR扩增,分别将两种产物回收,得到A和B片段;第二轮PCR:用片段A和片段B作为模板,将片段A和片段B等摩尔数加入,总量不超过100ng,引物只加入upper1和lower2,其他组分不变,首先设置温度梯度摸索合适的退火温度,然后用合适的退火温度进行PCR扩增,电泳观察后测序检测序列是否正确,获得纯的大片段PCR;步骤(2)Gibson同源重组:通过PCR的方法在DNA片段的两端加上同源片段,这部分对应的退火温度高于48摄氏度,将一个目的基因构建到表达载体上,同时在这个目的蛋白的N端融合上一个大的融合标签,帮助蛋白表达/检测/纯化;将设计引物扩增出这两个DNA片段,同时这两个DNA片段有各有一部分是同源的,同时这两个DNA片段与载体上各有一部分是同源的;然后,两个DNA片段进行克隆之后,再进行DNA纯化,最后将线性化的载体片段,这两个DNA片段和Gibson assembly master mix孵育一个小时后直接转化感受态细胞,实现将PCR组装到目标载体。
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