[发明专利]一种特异性接头分子标签及其在预测可变剪切中的应用在审
| 申请号： | 201910315777.X | 申请日： | 2019-04-19 |
| 公开（公告）号： | CN109988819A | 公开（公告）日： | 2019-07-09 |
| 发明（设计）人： | 聂俊伟;瞿志鹏;韩锦雄;曹林;张力军;叶廷跃 | 申请（专利权）人： | 南京诺唯赞生物科技有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/6806 | 分类号： | C12Q1/6806;C12N15/11 |
| 代理公司： | 南京天华专利代理有限责任公司 32218 | 代理人： | 杜静;徐冬涛 |
| 地址： | 210038 江苏省南*** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种特异性接头分子标签及其在预测可变剪切中的应用，包含：核心序列；随机序列(N)n，N为随机序列，共n个；和反向互补序列；其中核心序列如SEQ ID NO.1/SEQ ID NO.2所示，反向互补序列如SEQ ID NO.3所示。本发明在转座酶包埋复合物上增加特异性接头分子标签，使cDNA片段在不同酶切位点上连接的接头分子标签序列不同，在测序数据拼接时，带相同分子标签的cDNA片段连接在一起，得出转录本序列，检测可变剪接事件。本发明保证了拼接的高度准确性，还原了转录本的真实情况，在拼接的时候即使出现外显子跳跃情况，也能准确进行拼接，从而获得更多的遗传信息，增加可变剪切预测的数量。 | ||
| 搜索关键词： | 接头分子 拼接 可变剪切 反向互补序列 核心序列 随机序列 种特异性 标签 转录本 预测 剪接 高度准确性 外显子跳跃 标签序列 测序数据 分子标签 酶切位点 遗传信息 复合物 转座酶 可变 包埋 还原 应用 检测 保证 | ||
【主权项】：
1.一种特异性接头分子标签，其特征在于包含：核心序列；随机序列(N)n，N为随机序列，共n个；和反向互补序列；其中核心序列如SEQ ID NO.1/SEQ ID NO.2所示，反向互补序列如SEQ ID NO.3所示。
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