[发明专利]病原体操作组的检测方法、装置、计算机设备和存储介质有效

专利信息
申请号: 201910316653.3 申请日: 2019-04-19
公开(公告)号: CN109949866B 公开(公告)日: 2021-02-02
发明(设计)人: 孙亚洲;郭雨舜;杜晓骏;陈斌;杜刘稳 申请(专利权)人: 深圳市达仁基因科技有限公司
主分类号: G16B30/00 分类号: G16B30/00;G16B50/00
代理公司: 广州华进联合专利商标代理有限公司 44224 代理人: 谢曲曲;何平
地址: 518000 广东省深圳市前海深港合作区前*** 国省代码: 广东;44
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摘要: 本申请涉及一种病原体操作组的检测方法、装置、计算机设备和存储介质。方法包括:获取样本的测序数据;获取靶点数据库中存储的每个病原体操作组对应的特征靶点序列集合,特征靶点序列集合中包含病原体操作组中的满足预设特异性条件的特异性k‑mer,k‑mer是指长度为k的基因组序列;获取每个病原体操作组对应的特征靶点序列集合中包含的特异性k‑mer在测序数据中的出现次数;选取出现次数超过预设次数阈值的病原体操作组,作为测序数据包含的病原体操作组。通过将测序数据与各个病原体操作组对应的特征靶点序列进行比较从而得到测序数据包含的病原体操作组,减少了比较空间,从而缩短了分析时间,提高了检测的效率。
搜索关键词: 病原体 操作 检测 方法 装置 计算机 设备 存储 介质
【主权项】:
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