[发明专利]基于杂交、延伸连接反应的核酸捕获文库制备方法在审

专利信息
申请号: 201910318823.1 申请日: 2019-04-19
公开(公告)号: CN110241177A 公开(公告)日: 2019-09-17
发明(设计)人: 马晓玲;刘冬梅 申请(专利权)人: 上海三誉华夏基因科技有限公司
主分类号: C12Q1/6806 分类号: C12Q1/6806;C12N15/10;C40B50/06
代理公司: 苏州市中南伟业知识产权代理事务所(普通合伙) 32257 代理人: 郭磊
地址: 202162 上海市崇明区陈家镇瀛东村*** 国省代码: 上海;31
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摘要: 发明公开了基于杂交、延伸连接反应的核酸捕获文库制备方法,属于核酸检测技术领域。本发明通过设计捕获探针引物,然后与基因组DNA进行杂交反应,得到目的DNA片段后进行延伸、连接反应,后对目的DNA片段进行PCR扩增,纯化后即可进行文库测序。本发明的靶向区域捕获建库方法比较灵活,特异性高,捕获效率高,操作简单,耗时较短,并且能够尽量减少因PCR扩增效率差异造成的捕获区域均一性很差的现象。
搜索关键词: 连接反应 文库 核酸捕获 制备 捕获 延伸 杂交 核酸检测技术 基因组DNA 靶向区域 捕获区域 捕获探针 效率差异 杂交反应 均一性 测序 建库 引物 耗时 灵活
【主权项】:
1.一种基于杂交、延伸连接反应的核酸靶向捕获测序文库制备方法,其特征在于,包括如下步骤:(1)针对1~20位需要捕获的位点进行捕获探针引物设计,使目的区域延伸长度在150bp‑200bp之间;(2)将基因组DNA加热变性后,与步骤(1)设计的捕获探针引物、杂交液进行杂交,捕获探针引物与基因组DNA上的目的区域进行结合;(3)加入延伸反应试剂,对步骤(2)捕获成功的DNA片段进行碱基延伸反应;(4)添加连接反应试剂进行连接反应,连接步骤(3)延伸反应后DNA片段的缺口;(5)添加只对单链DNA片段作用的核酸酶,消化多余的脱氧核糖核苷三磷酸和杂交引物;(6)采用PCR反应扩增捕获成功的DNA片段,并加上测序所需的接头序列;(7)纯化后进行测序。
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