[发明专利]基于Sanger测序法对Pax1基因启动子区甲基化多位点的检测方法在审

专利信息
申请号: 201910333862.9 申请日: 2019-04-24
公开(公告)号: CN110106243A 公开(公告)日: 2019-08-09
发明(设计)人: 林东旭;刘小龙;魏国鹏 申请(专利权)人: 南京格致医学检验有限公司
主分类号: C12Q1/6869 分类号: C12Q1/6869
代理公司: 北京中企鸿阳知识产权代理事务所(普通合伙) 11487 代理人: 汪斌
地址: 212028 江苏省南京市高新技术*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 本发明涉及一种基于Sanger测序法对Pax1基因启动子区甲基化多位点的检测方法,本发明设计的pax1基因启动子区扩增引物分为两对,一对是甲基化扩增引物,一对是非甲基化扩增引物,扩增片段大小在150bp左右,片段包含了9个甲基化位点,扩增后配合ABI3720xl测序平台进行Sanger测序。本发明提供的方法能够一次测序可以拿到PAX1启动子区9个位点的甲基化情况结果,而现有Pax1探针法专利大多只检测一个位点,提供信息有限;Sanger测序的周期很短,比二代测序短5‑7天,和qPCR探针法相当;PCR加Sanger测序实验操作容易,测序结果判读直接一目了然,不需要数据分析经验。
搜索关键词: 甲基化 启动子区 扩增引物 测序 探针法 多位 检测 甲基化位点 测序平台 结果判读 扩增片段 情况结果 实验操作 数据分析 个位 扩增 位点 配合
【主权项】:
1.一种基于Sanger测序法对Pax1基因启动子区甲基化多位点的检测方法,按照先后顺序包括以下步骤:(1)将临床宫颈脱落细胞样本进行DNA提取,对提取的DNA进行浓度测定;(2)提取后的DNA进行重硫酸盐转化,反应后体系经过清洗纯化去重硫酸盐最后得到纯净的转化产物,直接用于下一步扩增;(3)将Multiplex PCR master mix、正向引物、反向引物、转化产物和无核酸水组成PCR体系进行PCR扩增;(4)将PCR产物纯化后进行测序。
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