[发明专利]一种BPDE加合靶蛋白的鉴定方法在审

专利信息
申请号: 201910428945.6 申请日: 2019-05-22
公开(公告)号: CN110133136A 公开(公告)日: 2019-08-16
发明(设计)人: 郑金平;王丹;吕懿;曹彬;穆箭兵 申请(专利权)人: 山西医科大学
主分类号: G01N30/02 分类号: G01N30/02;G01N30/72
代理公司: 太原科卫专利事务所(普通合伙) 14100 代理人: 张彩琴;李晓娟
地址: 030001 *** 国省代码: 山西;14
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摘要: 发明涉及BPDE加合靶蛋白的鉴定领域,具体是一种BPDE加合靶蛋白的鉴定方法。该方法包括1)收集细胞及提取蛋白;2)细胞裂解物的染毒及蛋白酶消化;3)质谱前样品准备;4)LC‑MS/MS分析:取肽段进行色谱分离;肽段分离后用质谱仪进行DDA质谱分析;5)质谱数据库检索:下载蛋白质数据库,根据质谱分析数据获得BPDE靶蛋白。该方法可直接鉴定蛋白裂解物中可与BPDE加合的靶蛋白,并且在检测过程中不需要对小分子进行化学修饰、不会影响到小分子原有的活性、不受任何细胞和组织类型限制、不要求使用纯蛋白质,甚至可以使用全细胞裂解物,可广泛应用于小分子加合靶蛋白的鉴定。
搜索关键词: 靶蛋白 加合 小分子 蛋白质数据库 全细胞裂解物 质谱分析数据 蛋白裂解物 蛋白酶消化 细胞裂解物 质谱数据库 细胞 纯蛋白质 化学修饰 鉴定领域 色谱分离 样品准备 质谱分析 组织类型 肽段分离 染毒 原有的 质谱仪 下载 质谱 肽段 检索 蛋白 检测 应用 分析
【主权项】:
1.一种BPDE加合靶蛋白的鉴定方法,其特征在于,包括以下步骤:1)收集细胞及提取蛋白2)细胞裂解物的染毒及蛋白酶消化蛋白样品分为两份,其中一份加入BPDE的DMSO溶液,另外一份加入等体积的DMSO溶剂,室温下静置孵育,孵育后的样品分别转入两个PCR管中,分别加入嗜热菌蛋白酶,在37℃条件下进行消化,然后分别加入4℃条件下预冷的蛋白酶抑制剂;3)质谱前样品准备加入蛋白酶抑制剂后的样品中分别加入尿素裂解液,4℃条件下离心,收集上清液;然后分别加入二硫苏糖醇,37℃条件下静置;然后冷却至室温后分别加入吲哚乙酸,室温避光下振荡;分别加入碳酸氢铵溶液以及胰蛋白酶,37℃条件下孵育;再分别加入三氟乙酸溶液,终止反应;酶解后的肽段分别使用C18 Cartridge固相萃取柱脱盐,真空冻干,用0.1% 甲酸水溶液复溶,肽段浓度测定,以备LC‑MS/MS分析;4)LC‑MS/MS分析取肽段进行色谱分离;肽段分离后用质谱仪进行DDA质谱分析;5)质谱数据库检索下载蛋白质数据库,根据质谱分析数据筛选出两份蛋白样品间的差异蛋白,获得BPDE靶蛋白。
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