[发明专利]一种BPDE加合靶蛋白的鉴定方法在审
申请号: | 201910428945.6 | 申请日: | 2019-05-22 |
公开(公告)号: | CN110133136A | 公开(公告)日: | 2019-08-16 |
发明(设计)人: | 郑金平;王丹;吕懿;曹彬;穆箭兵 | 申请(专利权)人: | 山西医科大学 |
主分类号: | G01N30/02 | 分类号: | G01N30/02;G01N30/72 |
代理公司: | 太原科卫专利事务所(普通合伙) 14100 | 代理人: | 张彩琴;李晓娟 |
地址: | 030001 *** | 国省代码: | 山西;14 |
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摘要: | 本发明涉及BPDE加合靶蛋白的鉴定领域,具体是一种BPDE加合靶蛋白的鉴定方法。该方法包括1)收集细胞及提取蛋白;2)细胞裂解物的染毒及蛋白酶消化;3)质谱前样品准备;4)LC‑MS/MS分析:取肽段进行色谱分离;肽段分离后用质谱仪进行DDA质谱分析;5)质谱数据库检索:下载蛋白质数据库,根据质谱分析数据获得BPDE靶蛋白。该方法可直接鉴定蛋白裂解物中可与BPDE加合的靶蛋白,并且在检测过程中不需要对小分子进行化学修饰、不会影响到小分子原有的活性、不受任何细胞和组织类型限制、不要求使用纯蛋白质,甚至可以使用全细胞裂解物,可广泛应用于小分子加合靶蛋白的鉴定。 | ||
搜索关键词: | 靶蛋白 加合 小分子 蛋白质数据库 全细胞裂解物 质谱分析数据 蛋白裂解物 蛋白酶消化 细胞裂解物 质谱数据库 细胞 纯蛋白质 化学修饰 鉴定领域 色谱分离 样品准备 质谱分析 组织类型 肽段分离 染毒 原有的 质谱仪 下载 质谱 肽段 检索 蛋白 检测 应用 分析 | ||
【主权项】:
1.一种BPDE加合靶蛋白的鉴定方法,其特征在于,包括以下步骤:1)收集细胞及提取蛋白2)细胞裂解物的染毒及蛋白酶消化蛋白样品分为两份,其中一份加入BPDE的DMSO溶液,另外一份加入等体积的DMSO溶剂,室温下静置孵育,孵育后的样品分别转入两个PCR管中,分别加入嗜热菌蛋白酶,在37℃条件下进行消化,然后分别加入4℃条件下预冷的蛋白酶抑制剂;3)质谱前样品准备加入蛋白酶抑制剂后的样品中分别加入尿素裂解液,4℃条件下离心,收集上清液;然后分别加入二硫苏糖醇,37℃条件下静置;然后冷却至室温后分别加入吲哚乙酸,室温避光下振荡;分别加入碳酸氢铵溶液以及胰蛋白酶,37℃条件下孵育;再分别加入三氟乙酸溶液,终止反应;酶解后的肽段分别使用C18 Cartridge固相萃取柱脱盐,真空冻干,用0.1% 甲酸水溶液复溶,肽段浓度测定,以备LC‑MS/MS分析;4)LC‑MS/MS分析取肽段进行色谱分离;肽段分离后用质谱仪进行DDA质谱分析;5)质谱数据库检索下载蛋白质数据库,根据质谱分析数据筛选出两份蛋白样品间的差异蛋白,获得BPDE靶蛋白。
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