[发明专利]一种绵羊全基因组重测序分析方法在审
| 申请号： | 201910448101.8 | 申请日： | 2019-05-27 |
| 公开（公告）号： | CN110189796A | 公开（公告）日： | 2019-08-30 |
| 发明（设计）人： | 依明·苏来曼;阿布来提·苏来曼;决肯·阿尼瓦什;刘武军;黄锡霞;黄李勇;赵雄 | 申请（专利权）人： | 新疆农业大学 |
| 主分类号： | G16B20/20 | 分类号： | G16B20/20;G16B20/00 |
| 代理公司： | 北京方圆嘉禾知识产权代理有限公司 11385 | 代理人： | 董芙蓉 |
| 地址： | 830052 新疆维吾尔自治区乌鲁*** | 国省代码： | 新疆;65 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种绵羊全基因组重测序分析方法，涉及基因技术领域。本发明方法包括以下步骤：(1)获取绵羊DNA，检测其纯度、浓度及体积，对检测合格后的样品进行文库制备和文库质检，对质检合格的文库进行测序，获得绵羊原始测序数据；(2)对所述绵羊原始测序数据进行数据过滤并评估测序质量，经数据质控合格后获得目标分析序列数据；(3)将所述目标分析序列数据比对到绵羊参考基因组上，经比对指标质控合格后获得比对上的数据；(4)检测所述比对上的数据的单核苷酸SNP变异、小片段插入缺失变异InDel及染色体结构变异SV，并进行注释，获得绵羊全基因组测序序列中的SNP数据信息、InDel数据信息和SV数据信息。 | ||
| 搜索关键词： | 绵羊 比对 全基因组 文库 测序分析 测序数据 目标分析 数据信息 序列数据 测序 质检 质控 检测 染色体结构变异 测序序列 单核苷酸 基因技术 缺失变异 数据过滤 基因组 小片段 制备 参考 评估 | ||
【主权项】：
1.一种绵羊全基因组重测序分析方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤：(1)获取绵羊DNA，检测所述DNA的纯度、浓度及体积，对检测合格后的样品进行文库制备和文库质检，对质检合格的文库进行测序，获得绵羊原始测序数据；(2)对所述绵羊原始测序数据进行数据过滤并评估测序质量，经数据质控合格后获得目标分析序列数据；(3)将所述目标分析序列数据比对到绵羊参考基因组上，经比对指标质控合格后获得比对上的数据；(4)检测所述比对上的数据的单核苷酸SNP变异、小片段插入缺失变异InDel及染色体结构变异SV，并进行注释，获得绵羊全基因组测序序列中的SNP数据信息、InDel数据信息和SV数据信息。
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