[发明专利]基于高性能计算平台的小分子靶标核酸适配体计算机辅助筛选方法及小分子靶标核酸适配体

摘要

本发明提供了一种基于高性能计算平台的小分子靶标核酸适配体计算机辅助筛选方法，涉及分子生物学技术领域。首先对小分子靶标进行结构分析，其次在小分子化合物库中进行筛选，如符合匹配原则，则作为目标小分子靶标，与核酸分子进行分子对接，如不符合匹配原则，则可进行分子结构构建，将分子结构构建后的小分子靶标作为目标小分子靶标，与核酸分子进行分子对接，如果对接成功，则核酸分子为初选核酸适配体，解决了小分子靶标与核酸分子的结合位点少、亲和力弱，核酸分子抓靶困难、耗材多，小分子靶标结合核酸形成的复合物与核酸自身的大小、质量、电荷性质等方面差异较小，二者的分离难度大的问题。

主权项

1.一种基于高性能计算平台的小分子靶标核酸适配体计算机辅助筛选方法，其特征在于，包括：步骤一，对小分子靶标进行结构分析；步骤二，根据匹配原则，在小分子化合物库中对小分子靶标进行筛选；判断所述小分子靶标是否符合所述匹配原则；如果所述小分子靶标符合所述匹配原则，则所述小分子靶标作为目标小分子靶标；如果所述小分子靶标不符合所述匹配原则，则根据靶标小分子结构式进行分子结构构建，将分子结构构建后的小分子靶标作为目标小分子靶标；步骤三，所述目标小分子靶标在核酸分子数据库中与核酸分子进行分子对接，判断所述目标小分子靶标与所述核酸分子是否对接成功：如果对接成功，则所述核酸分子为初选核酸适配体；如果对接不成功，则重复步骤三。