[发明专利]一种肿瘤个体化疫苗的有效新抗原肽的快速筛选方法

摘要

本发明公开一种肿瘤个体化疫苗的抗原肽筛选方法，所述筛选的步骤包括：a)获取患者肿瘤细胞；b)对所述肿瘤细胞进行基因组全外显子测序，得到所述患者的全外显子突变数据集；c)根据所述全外显子突变数据集，预测外显子突变所形成的一批新抗原肽；d)计算各新抗原肽的MHC I亲合力变化度；e)计算该患者外周血淋巴细胞总数存留度，依据淋巴细胞总数存留度与高T细胞活性的新抗原肽MHC I亲合力变化度的相互关系，确定高T细胞活性的新抗原肽MHC I亲合力变化度区间；f)将该患者处于该区间的新抗原肽筛选为对该患者免疫有效的新抗原肽，以制备个体化疫苗。

主权项

1.一种肿瘤个体化疫苗的抗原肽筛选方法，所述筛选的步骤包括：a)获取同一患者的肿瘤细胞与正常细胞；b)对所述肿瘤细胞进行全外显子基因测序，得到所述患者的肿瘤全外显子数据集，对所述正常细胞进行全外显子基因测序，得到所述患者的正常全外显子数据集；c)对比所述肿瘤全外显子数据集与所述正常全外显子数据集，得到所述患者的所述肿瘤全外显子数据集中特有的外显子数据，形成所述患者的突变全外显子数据集；将所述正常全外显子数据集与所述突变全外显子数据集对应的外显子的集合称作对照全外显子数据集；d)对比所述突变全外显子数据集与正常人群SNP数据库，得到所述正常人群SNP数据库中不存在的所述突变全外显子数据集的子数据集，形成所述患者的突变外显子数据集；将所述突变外显子数据集翻译成肽，形成突变抗原肽数据集；将所述对照全外显子数据集中与所述突变外显子数据集对应的所有外显子翻译成肽，形成对照野生抗原肽数据集；e)针对所述突变抗原肽数据集中每一条突变多肽，将所述对照抗原肽数据集中对应的多肽称作对照多肽，比较所述突变多肽的MHC I亲合力与所述对照多肽的MHC I亲合力，得到所述突变多肽的MHC I类分子亲和力变化度得分，得到亲和力变化度得分数据集；f)计算所述患者外周血淋巴细胞总数变化度，依据淋巴细胞总数变化度与高T细胞活性的突变抗原肽MHC I亲合力变化度得分的关系，确定高T细胞活性的突变抗原肽MHC I亲合力变化度区间；g)将所述患者处于所述变化度区间的突变抗原肽筛选为对所述患者免疫有效的突变抗原肽，称作新抗原肽，供个体化疫苗制备。