[发明专利]一种预测中药复方直接靶点和作用成分的方法有效
| 申请号： | 201910562690.2 | 申请日： | 2019-06-26 |
| 公开（公告）号： | CN110322929B | 公开（公告）日： | 2022-11-29 |
| 发明（设计）人： | 鲁路;倪世豪;孙术宁 | 申请（专利权）人： | 广州中医药大学第一附属医院 |
| 主分类号： | G16B25/10 | 分类号： | G16B25/10;G16B40/00;G16C20/20;G16C20/50 |
| 代理公司： | 广州三环专利商标代理有限公司 44202 | 代理人： | 颜希文;宋静娜 |
| 地址： | 510405 广*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种预测中药复方直接靶点和作用成分的方法，包括以下步骤：首先对基因表达数据库进行挖掘，建立靶点敲除/过表达的特征基因数据库；在数据库中收集复方中可能存在的活性成分，并建模，提取分子电子指纹特征；基于特征基因数据库，对组学数据进行基因组富集分析，筛选组方可能作用的直接靶点；对预测到的靶点，基于公共数据库筛选已验证过活性的小分子，记录小分子的活性性质和活性数据；基于回归机器学习模型对活性数据建立预测模型，基于分类器机器学习模型对活性性质进行模型预测；基于建立的预测模型，预测中收集到的方剂活性成分。通过分子对接联合机器学习的方法成功预测中药复方中有效成分。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 预测 中药 复方 直接 作用 成分 方法 | ||
【主权项】：
1.一种预测中药复方直接靶点和作用成分的方法，其特征在于，包括以下步骤：S1、对基因表达数据库进行挖掘，建立靶点敲除/过表达的特征基因数据库；S2、基于中药与化学成分数据库，收集复方中可能存在的活性成分，使用Chem Draw进行建模，应用Rpci包提取分子电子指纹特征；S3、基于步骤S1的敲除/过表达数据库，对组学数据进行基因组富集分析，筛选组方可能作用的直接靶点；S4、对步骤S3预测到的靶点，基于公共数据库筛选已验证过活性的小分子，记录小分子的活性性质和活性数据；S5、基于回归机器学习模型对步骤S4的活性数据建立预测模型，基于分类器机器学习模型对活性性质进行模型预测；S6、基于步骤S5建立的预测模型，预测步骤S2中收集到的方剂活性成分；S7、通过生物学实验证活性成分对靶点的效果。
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