[发明专利]一种基于病原宏基因二代测序的解读方法在审
| 申请号： | 201910569029.4 | 申请日： | 2019-06-27 |
| 公开（公告）号： | CN110335656A | 公开（公告）日： | 2019-10-15 |
| 发明（设计）人： | 缪青;胡必杰;陈翔;林佳冰;黄英男;蔡思诗 | 申请（专利权）人： | 复旦大学附属中山医院 |
| 主分类号： | G16H15/00 | 分类号： | G16H15/00;G16H50/20;G16B30/00;G16B50/00 |
| 代理公司： | 上海容慧专利代理事务所(普通合伙) 31287 | 代理人： | 于晓菁 |
| 地址： | 200032 *** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种基于病原宏基因二代测序的解读方法，包括：大量检出序列符合以下至少1条：覆盖度：种水平为其它任何种的10倍以上；丰度：占60％以上；序列数：在总序列数的值正常的情况下，SMRN或SDMRN超过1万；中量检出序列符合以下至少1条：覆盖度：种水平为其它任何种的4‑10倍；丰度：占40％‑60％；序列数：在总序列数的值正常的情况下，SMRN或SDMRN：5千～1万；少量或极少量检出序列符合以下至少1条：定植与致病无法区分；不是此类标本的常见背景菌，或不符合背景菌的一般特点。本发明结论较为客观，可随时根据标准进行解读，具有临床实用性及客观性，报告结论可直接用于临床实践。 | ||
| 搜索关键词： | 检出 解读 病原 背景菌 覆盖度 测序 丰度 临床实用 基因 定植 标本 | ||
【主权项】：
1.一种基于病原宏基因二代测序的解读方法，其特征在于，包括：‑大量检出序列符合以下至少1条：关于覆盖度：种水平为其它任何种的10倍以上；关于丰度：占60％以上；关于序列数：在总序列数的值正常的情况下，SMRN或SDMRN超过1万；‑中量检出序列符合以下至少1条：关于覆盖度：种水平为其它任何种的4‑10倍；关于丰度：占40％‑60％；关于序列数：在总序列数的值正常的情况下，SMRN或SDMRN：5千～1万；‑少量或极少量检出序列符合以下至少1条：定植与致病无法区分；不是此类标本的常见背景菌，或不符合背景菌的一般特点。
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