[发明专利]克隆自CNV片段的与猪耳形性状相关的分子标记有效

专利信息
申请号: 201910680683.2 申请日: 2019-07-23
公开(公告)号: CN110373477B 公开(公告)日: 2021-05-07
发明(设计)人: 刘小磊;许婧雅;马云龙;余梅;尹立林;唐振双;殷东;赵书红;项韬;朱猛进;李新云 申请(专利权)人: 华中农业大学
主分类号: C12Q1/6888 分类号: C12Q1/6888;C12N15/11
代理公司: 武汉宇晨专利事务所 42001 代理人: 张红兵
地址: 430070 湖*** 国省代码: 湖北;42
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摘要: 发明属于猪分子标记筛选技术领域,具体涉及克隆自CNV片段的与猪耳形性状相关的分子标记。该分子标记为通过整合NCBI数据库和欧洲生物信息研究所公开的包含58个品种的469头猪的重测序数据,对比猪参考基因组序列获得基因分型数据,根据全基因组关联分析(GWAS)技术得到一种与猪耳形性状关联的拷贝数变异分子标记(CNV),当个体拥有该片段的多拷贝(拷贝数3)时,则有利于猪拥有非直立的耳形,该片段的核苷酸序列如序列表中所示。公开了筛选与猪耳形相关分子标记的方法及其关联分析方法的应用。本发明为猪耳形的标记辅助选择提供了遗传标记资源。
搜索关键词: 克隆 cnv 片段 猪耳形 性状 相关 分子 标记
【主权项】:
1.克隆自CNV片段的与猪耳形性状相关的分子标记,其特征在于,所述的分子标记的CNV片段为猪五号染色体上Chr5:29826401‑29866000bp的拷贝数变异,该片段拷贝数为2,3,4,5或6,该标记的核苷酸序列如序列表SEQ ID NO:1所示,当个体拥有该片段的拷贝数>3时,有利于猪拥有非直立的耳形。
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