[发明专利]检测基因型的RNA环化效率的方法在审
申请号: | 201910690857.3 | 申请日: | 2019-07-29 |
公开(公告)号: | CN112301109A | 公开(公告)日: | 2021-02-02 |
发明(设计)人: | 张亚平;刘露;李应菊;周中银;高云 | 申请(专利权)人: | 中国科学院昆明动物研究所 |
主分类号: | C12Q1/6851 | 分类号: | C12Q1/6851;C12N15/11 |
代理公司: | 北京华进京联知识产权代理有限公司 11606 | 代理人: | 宁菁 |
地址: | 650223 云*** | 国省代码: | 云南;53 |
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摘要: | 本发明涉及一种检测基因型的RNA环化效率的方法,主要包括如下的步骤:1)根据环状RNA与线性RNA在结构上的不同,分别设计所述环状RNA的上、下游引物与所述线性RNA的上、下游引物,以区分所述线性RNA和所述环状RNA;2)根据所述基因型所对应的基因型位点设计探针;3)使用步骤1)和2)中所获得的所述上、下游引物和所述探针,通过ddPCR仪对待测cDNA样品分别进行所述线性RNA和所述环状RNA的绝对定量检测,得到所述基因型的环状RNA序列拷贝数和所述基因型的线性RNA序列拷贝数;4)根据公式计算所述基因型的RNA环化效率。该方法成本低、结果分析时间短、操作简单,检测数据准确,不需要对现有的仪器和试剂进行改造。 | ||
搜索关键词: | 检测 基因型 rna 环化 效率 方法 | ||
【主权项】:
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