[发明专利]一种与猪体长性状相关的InDel分子标记在审
| 申请号： | 201910705906.6 | 申请日： | 2019-07-24 |
| 公开（公告）号： | CN110273011A | 公开（公告）日： | 2019-09-24 |
| 发明（设计）人： | 刘小磊;许婧雅;朱猛进;赵云霞;刘向东;倪德斌;刘望宏;周全;谢胜松;马云龙;项韬;赵书红;余梅;李新云 | 申请（专利权）人： | 华中农业大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6888 | 分类号： | C12Q1/6888;C12N15/11 |
| 代理公司： | 武汉宇晨专利事务所 42001 | 代理人： | 张红兵 |
| 地址： | 430070 湖*** | 国省代码： | 湖北;42 |
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| 摘要： | 本发明属于猪分子标记筛选技术领域，具体涉及一种与猪体长相关的InDel分子标记。通过整合NCBI数据库和欧洲生物信息研究所中公开的包含58个品种的469头猪的重测序数据，对比猪参考基因组序列获得基因分型数据，得到一种与猪体长性状相关的分子标记，该分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，在该序列的第51‑52位碱基处存在一个AT/A的碱基缺失。当个体拥有该InDel时，具有更小的体长。本发明公开了筛选与猪体长相关分子标记的方法及其关联分析方法的应用。为猪体长的标记辅助选择提供了一个新的InDel分子标记资源。 | ||
| 搜索关键词： | 猪体 分子标记 性状 参考基因组序列 筛选 标记辅助选择 核苷酸序列 猪分子标记 测序数据 关联分析 基因分型 碱基缺失 生物信息 位碱基 体长 整合 应用 | ||
【主权项】：
1.一种与猪体长性状相关的InDel分子标记，其特征在于，所述的分子标记的核苷酸序列如下所示：GACTTGTAGGTCAATGCCATTGGCTCCTCCACTTTCTCAATATCTTAGAAAT(AT/A)TTT TTTTTCTTCTTAGGGACACACCTGCAGCAATTGGAAATTCCCAGGC，在上述序列的51‑52bp碱基处存在一个AT/A的碱基缺失，当个体基因型为AA时，不利于个体体长的增加。
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