[发明专利]对目标序列进行模拟的方法、装置和电子设备在审
申请号: | 201910784122.7 | 申请日: | 2019-08-23 |
公开(公告)号: | CN110706737A | 公开(公告)日: | 2020-01-17 |
发明(设计)人: | 杨梦成;荆瑞琳;杜洋;李大为;玄兆伶;王海良;王娟;肖飞 | 申请(专利权)人: | 浙江安诺优达生物科技有限公司;安诺优达基因科技(北京)有限公司 |
主分类号: | G16B5/00 | 分类号: | G16B5/00;G16B30/00 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 322000 浙江省金华市义*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | 本申请涉及一种对目标序列进行模拟的方法、装置和电子设备。该方法包括:获取参比序列和待拟合序列;基于目标序列的碱基对应的参比序列的基准参数和待拟合序列的基准参数,获得碱基的比较参数,其中,待拟合序列的基准参数基于多个碱基获得;基于比较参数确定碱基是否合格以获得合格碱基和不合格碱基;对不合格碱基的比较参数进行迭代消减以获得目标参数,迭代消减的迭代次数基于比较参数,且每次迭代消减与至少一个碱基的至少一个比较参数相关联;以及,基于合格碱基和不合格碱基的目标参数确定目标序列的模拟后的序列。这样,可以模拟真实靶向捕获测序数据的参数波动,使模拟数据更加贴近真实。 | ||
搜索关键词: | 碱基 比较参数 迭代 基准参数 目标序列 拟合 消减 目标参数 参比 参数波动 测序数据 电子设备 模拟数据 靶向 捕获 关联 申请 | ||
【主权项】:
1.一种对目标序列进行模拟的方法,其特征在于,包括:/n获取参比序列和待拟合序列,且所述待拟合序列包含所述目标序列;/n基于所述目标序列的碱基对应的所述参比序列的碱基的基准参数和所述待拟合序列的碱基的基准参数,获得所述目标序列的碱基的比较参数,其中,所述待拟合序列的基准参数基于至少一个所述待拟合序列的碱基的比较参数获得;/n基于所述目标序列的比较参数确定所述目标序列的碱基是否合格以获得所述目标序列的合格碱基和不合格碱基;/n对所述不合格碱基的所述比较参数进行迭代消减以获得目标参数,所述迭代消减的迭代次数基于所述比较参数,且每次迭代消减与至少一个碱基的至少一个比较参数相关联;以及/n基于所述合格碱基和所述不合格碱基的所述目标参数确定所述目标序列的模拟后的序列。/n
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