[发明专利]一种快速的批量化SNP/Indel引物设计的方法及系统有效
| 申请号： | 201910798281.2 | 申请日： | 2019-08-27 |
| 公开（公告）号： | CN110491446B | 公开（公告）日： | 2023-04-07 |
| 发明（设计）人： | 田彩霞;董亚晨;刘露露 | 申请（专利权）人： | 上海美吉生物医药科技有限公司 |
| 主分类号： | G16B20/20 | 分类号： | G16B20/20;G16B30/10 |
| 代理公司： | 北京哌智科创知识产权代理事务所(普通合伙) 11745 | 代理人： | 何浩 |
| 地址： | 200120 上海市浦东新区中国(上海)*** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种快速的批量化SNP/Indel引物设计的方法及系统，包括：对变异检测获得的VCF文件进行标记过滤；根据标记过滤后所得的变异位点在参考基因组中的位置信息，提取引物设计的任务序列，并基于提取的任务序列结合设定的引物设计参数，生成选定的引物设计软件输入所需格式的输入文件；使用选定的引物设计软件，根据输入文件进行引物设计；对选定的引物设计软件完成引物设计后的输出文件，按照预设格式要求进行格式整理，生成最终所需的结果文件。本发明可解决基于有参考基因组的变异检测分析所获得的大量SNP和Indel标记的引物设计问题，实现大批量引物设计的一键化，流程速度快，结果归纳明晰，大幅度提升了分析效率。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 快速 批量 snp indel 引物 设计 方法 系统 | ||
【主权项】：
1.一种快速的批量化SNP/Indel引物设计的方法，其特征在于，包括：/n对变异检测获得的VCF文件进行标记过滤；/n根据标记过滤后所得的变异位点在参考基因组中的位置信息，提取引物设计的任务序列，并基于提取的任务序列结合设定的引物设计参数，生成选定的引物设计软件输入所需格式的输入文件；/n使用所述选定的引物设计软件，根据所述输入文件进行引物设计；/n对所述选定的引物设计软件完成引物设计后的输出文件，按照预设格式要求进行格式整理，生成最终所需的结果文件。/n
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