[发明专利]一种水稻耐低温基因COLD1新功能标记的设计及其检测方法在审
| 申请号： | 201910806895.0 | 申请日： | 2019-08-29 |
| 公开（公告）号： | CN110540987A | 公开（公告）日： | 2019-12-06 |
| 发明（设计）人： | 田孟祥;宫彦龙;何友勋;雷月;张时龙;余本勋;李佳丽;宋治豪;余莉;张大双;闫志强;吴美玲;何远宽;吴瑞;叶永印 | 申请（专利权）人： | 毕节市农业科学研究所;贵州省水稻研究所 |
| 主分类号： | C12N15/11 | 分类号： | C12N15/11;C12Q1/6895;C12Q1/6806 |
| 代理公司： | 50230 重庆市信立达专利代理事务所(普通合伙) | 代理人： | 陈炳萍<国际申请>=<国际公布>=<进入 |
| 地址： | 551714 *** | 国省代码： | 贵州;52 |
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| 摘要： | 本发明属于农作物育种技术领域，公开了一种水稻耐低温基因COLD1新功能标记的设计及其检测方法。根据COLD1基因在籼、粳编码区SNP2的等位单核苷酸差别，粳型COLD1Jap为碱基A，籼型COLD1Ind为碱基T或C，设计由5条引物组成的功能标记。5条引物混合在同管里进行PCR；正向外引物COLD1‑O‑F和反向内引物COLD1‑I‑R扩增粳型COLD1Jap的特征条带；反向外引物COLD1‑O‑R与2条内正向内引物即COLD1‑I‑F1和COLD1‑I‑F2扩增籼型COLD1Ind的特征条带。本发明能简便高效地对基因COLD1类型进行鉴别，可用于目的基因的资源鉴定和分子标记辅助育种。 | ||
| 搜索关键词： | 扩增 条带 引物 基因 分子标记辅助育种 反向内引物 反向外引物 农作物育种 正向内引物 正向外引物 单核苷酸 功能标记 目的基因 资源鉴定 编码区 耐低温 新功能 碱基A 碱基T 可用 鉴别 水稻 检测 | ||
【主权项】：
1.一种水稻耐低温基因COLD1新功能标记的引物，其特征在于，所述水稻耐低温基因COLD1新功能标记由5条引物组成，即正、反向外引物各1条，正向内引物2条，反向内引物1条；正向外引物用COLD1-O-F表示，反向外引物用COLD1-O-R表示；检测粳型COLD1Jap的反向内引物为COLD1-I-R；检测籼型COLD1Ind的正向内引物有两条，即COLD1-I-F1和COLD1-I-F2；/nCOLD1-O-F序列为CATTTCCCCATGCCTTCTCC；/nCOLD1-O-R序列为CAACTGTCCCAACGATACGC；/nCOLD1-I-F1序列为CCTGGCTTACAGGGAAATTGATGAGAT；/nCOLD1-I-F2序列为CTGGCTTACAGGGAAATTGATGAGAC；/nCOLD1-I-R序列为GAGCTGCCTTTCCAATGTTTTGATGTTCT。/n
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