[发明专利]肿瘤新抗原的预测方法及其应用有效
| 申请号： | 201910809829.9 | 申请日： | 2019-08-29 |
| 公开（公告）号： | CN110600077B | 公开（公告）日： | 2022-07-12 |
| 发明（设计）人： | 徐冰;张静波;单光宇;伍启熹;王建伟;刘倩;唐宇 | 申请（专利权）人： | 北京优迅医学检验实验室有限公司 |
| 主分类号： | G16B20/20 | 分类号： | G16B20/20;G16B20/50;G16B25/10;G16B30/10;G16B50/30 |
| 代理公司： | 北京康信知识产权代理有限责任公司 11240 | 代理人： | 梁文惠 |
| 地址： | 100195 北京市海淀区*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种肿瘤新抗原的预测方法及其应用。其中，该预测方法包括以下步骤：S1，获取肿瘤患者的肿瘤样本和血浆白细胞样本，构建测序文库并且进行全基因组、全外显子组或靶向捕获RNA、DNA测序；S2，以血浆白细胞DNA作为对照，对肿瘤样本DNA进行比对及体细胞突变的检出，过滤出错义突变位点并对过滤出的错义突变位点进行注释；S3，采用血浆白细胞DNA测序数据对HLA‑I类及HLA‑II类等位基因进行分型；S4，预测可与HLA‑I类及HLA‑II类等位基因结合的抗原多肽。应用本发明的技术方案，可以更准确筛选出基因可表达的与HLA‑I类及HLA‑II类等位基因结合并引起抗肿瘤免疫反应的抗原。 | ||
| 搜索关键词： | 肿瘤 抗原 预测 方法 及其 应用 | ||
【主权项】：
1.一种肿瘤新抗原的预测方法，其特征在于，包括以下步骤：/nS1，获取肿瘤患者的肿瘤样本和血浆白细胞样本，分别提取所述肿瘤样本的RNA和DNA以及所述血浆白细胞样本的DNA，构建测序文库并且进行全基因组、全外显子组或靶向捕获RNA、DNA测序；/nS2，以血浆白细胞DNA作为对照，对肿瘤样本DNA进行比对及体细胞突变的检出，过滤出错义突变位点并对过滤出的所述错义突变位点进行注释；/nS3，采用血浆白细胞DNA测序数据对HLA-I类及HLA-II类等位基因进行分型；/nS4，以HLA-I类及HLA-II类等位基因分型为基础，结合所述S2得到的信息，预测可与HLA-I类及HLA-II类等位基因结合的抗原多肽。/n
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