[发明专利]xCas9n-epBE碱基编辑系统在基因编辑中的应用有效
申请号: | 201910812816.7 | 申请日: | 2019-08-30 |
公开(公告)号: | CN110577965B | 公开(公告)日: | 2022-12-20 |
发明(设计)人: | 杨进孝;徐雯;刘亚;王飞鹏;袁爽 | 申请(专利权)人: | 北京市农林科学院 |
主分类号: | C12N15/84 | 分类号: | C12N15/84;C12N15/90;C12N9/22;C07K19/00;A01H5/00;A01H6/46 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 关畅 |
地址: | 100097 北京市海淀区曙*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本发明公开了xCas9n‑epBE碱基编辑系统在基因编辑中的应用。本发明公开的xCas9n‑epBE碱基编辑系统包括xCas9n、PmCDA1、UGI和tRNA‑esgRNA;所述tRNA‑esgRNA靶向靶点序列;所述tRNA‑esgRNA如式I所示:tRNA‑所述靶点序列转录的RNA‑esgRNA骨架(式I)。通过实验证明:本发明的xCas9n‑epBE碱基编辑系统在植物基因组中实现了靶点序列的编辑,尤其是在PAM序列为NGT、NGA、NGG、GAA或GAT时实现了靶点序列中由碱基C到碱基T的替换。本发明的xCas9n‑epBE碱基编辑系统在植物或动物基因编辑中具有广泛的应用前景。 | ||
搜索关键词: | xcas9n epbe 碱基 编辑 系统 基因 中的 应用 | ||
【主权项】:
1.基因组靶点序列的编辑方法,为方法(一)或方法(二)或方法(三)或方法(四):/n所述方法(一)包括如下步骤:将xCas9n的编码基因、转录tRNA-esgRNA的DNA分子、PmCDA1的编码基因和UGI的编码基因导入生物体或生物细胞内,使所述xCas9n、所述tRNA-esgRNA、所述PmCDA1和所述UGI的编码基因均得到表达,实现基因组靶点序列的编辑;/n所述方法(二)包括如下步骤:将xCas9n的编码基因、转录tRNA-esgRNA的DNA分子和PmCDA1的编码基因导入生物体或生物细胞内,使所述xCas9n、所述tRNA-esgRNA和所述PmCDA1的编码基因均得到表达,实现基因组靶点序列的编辑;/n所述方法(三)包括如下步骤:将xCas9n、tRNA-esgRNA、PmCDA1和UGI导入生物体或生物细胞内,实现基因组靶点序列的编辑;/n所述方法(四)包括如下步骤:将xCas9n、tRNA-esgRNA和PmCDA1导入生物体或生物细胞内,实现基因组靶点序列的编辑;/n所述tRNA-esgRNA靶向所述靶点序列;/n所述tRNA-esgRNA如式I所示:tRNA-所述靶点序列转录的RNA-esgRNA骨架(式I);/n所述tRNA为m1)或m2)或m3):/nm1)将序列1第474-550位中的T替换为U得到的RNA分子;/nm2)将m1)所示的RNA分子经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且具有相同功能的RNA分子;/nm3)与m1)或m2)限定的核苷酸序列具有75%或75%以上同一性且具有相同功能的RNA分子;/n所述esgRNA骨架为n1)或n2)或n3):/nn1)将序列1第571-656位中的T替换为U得到的RNA分子;/nn2)将n1)所示的RNA分子经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且具有相同功能的RNA分子。/nn3)与n1)或n2)限定的核苷酸序列具有75%或75%以上同一性且具有相同功能的RNA分子;/n所述靶点序列的PAM序列为如下任一种:NGT、NGA、NGG、GAA、GAT;N为A、T、C或G。/n
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