[发明专利]FFPE样本DNA文库及其构建方法在审
| 申请号： | 201910848843.X | 申请日： | 2019-09-09 |
| 公开（公告）号： | CN110511978A | 公开（公告）日： | 2019-11-29 |
| 发明（设计）人： | 刘运超;李富威;方楠;伍启熹;王建伟;刘倩;唐宇 | 申请（专利权）人： | 北京优迅医学检验实验室有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/6806 | 分类号： | C12Q1/6806;C12N15/10;C40B50/06 |
| 代理公司： | 11240 北京康信知识产权代理有限责任公司 | 代理人： | 路秀丽<国际申请>=<国际公布>=<进入 |
| 地址： | 100195 北京市海淀区*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明提供了一种FFPE样本DNA文库及其构建方法。该构建方法包括对FFPE样本DNA进行变性处理，得到单链DNA；采用随机引物对单链DNA进行随机扩增延伸，得到双链DNA，随机引物按5’端到3’端的方向依次包含第一端接头序列及随机序列；对双链DNA进行第二端接头的连接，得到连接产物；对连接产物进行PCR富集，得到FFPE样本DNA文库。上述方法中第一端接头的连接通过PCR扩增的方式引入，因而接头连接体系与PCR富集体系兼容性强，便于省掉接头连接后磁珠纯化过程以降低模板的损失，既简化操作流程，又提高建库成功率，有效解决了降解严重的FFPE样本建库困难及DNA模板利用率低的问题。 | ||
| 搜索关键词： | 样本DNA 接头连接 连接产物 随机引物 单链DNA 双链DNA 第一端 富集 构建 建库 文库 变性处理 操作流程 磁珠纯化 接头序列 随机扩增 随机序列 有效解决 端接头 兼容性 降解 成功率 样本 引入 延伸 | ||
【主权项】：
1.一种FFPE样本DNA文库的构建方法，其特征在于，所述构建方法包括：/n对FFPE样本DNA进行变性处理，得到单链DNA；/n采用随机引物对所述单链DNA进行随机扩增延伸，得到双链DNA，所述随机引物按5’端到3’端的方向依次包含第一端接头序列及随机序列；/n对所述双链DNA进行第二端接头的连接，得到连接产物；/n对所述连接产物进行PCR富集，得到所述FFPE样本DNA文库。/n
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