[发明专利]一种蛋白质O-GalNAc修饰快速搜库和深度覆盖新方法有效
| 申请号： | 201910851014.7 | 申请日： | 2019-09-10 |
| 公开（公告）号： | CN110632323B | 公开（公告）日： | 2022-08-30 |
| 发明（设计）人： | 秦伟捷;张万军;赵新元;李圆圆;焦丰龙 | 申请（专利权）人： | 北京蛋白质组研究中心;中国人民解放军军事科学院军事医学研究院 |
| 主分类号： | G01N33/68 | 分类号： | G01N33/68;G06F16/903;G06F16/906;G16B50/30 |
| 代理公司： | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人： | 张立娜 |
| 地址： | 102206 北*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种蛋白质O‑GalNAc修饰快速搜库和深度覆盖新方法。本发明一方面，通过对O‑GalNAc糖肽谱图中氧鎓离子和唾液酸碎片的谱图提取和分类的策略，针对不同类型的谱图进行相应匹配的O‑糖糖型数据库检索，大幅减少数据库检索空间，缩短搜库耗时；另一方面，针对完整O‑GalNAc糖肽在质谱DDA扫描模式下的多样本检测中存在大量缺失值的问题，依据多样本实验中已鉴定的完整O‑GalNAc糖肽，利用校正保留时间及质谱一级质量数匹配的方式，进行不同样本间完整O‑GalNAc糖肽定量缺失值的补充，大幅提高了多样本检测时O‑GalNAc糖肽的鉴定覆盖度，改善了定量重现性。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 蛋白质 galnac 修饰 快速 深度 覆盖 新方法 | ||
【主权项】：
1.一种蛋白质O-GalNAc修饰搜库方法，包括如下步骤：/n(A1)从O-GalNAc修饰肽段的质谱谱图中提取糖肽谱图；/n(A2)根据是否含有唾液酸碎片，对步骤(A1)中所得的所述糖肽谱图进行分类，分为含有唾液酸碎片的谱图和不含有唾液酸碎片的谱图；/n(A3)对所述含有唾液酸碎片的谱图进行含唾液酸O-GalNAc糖型的数据库检索，对所述不含唾液酸碎片的谱图进行不含唾液酸O-GalNAc糖型的数据库检索。/n
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