[发明专利]精确大片段基因删除结合终止密码子插入的基因敲除法无效

专利信息
申请号: 201910890379.0 申请日: 2019-09-20
公开(公告)号: CN110541001A 公开(公告)日: 2019-12-06
发明(设计)人: 赵培;康雅虹;罗莹 申请(专利权)人: 福建上源生物科学技术有限公司
主分类号: C12N15/89 分类号: C12N15/89;C12N15/90
代理公司: 35219 福州市景弘专利代理事务所(普通合伙) 代理人: 林祥翔;郭鹏飞<国际申请>=<国际公布>
地址: 350004 福建省福州市台江区*** 国省代码: 福建;35
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摘要: 发明属于基因工程的基因编辑技术领域,更具体地涉及一种高效的基因敲除法,即精确大片段基因删除结合终止密码子插入的基因敲除法。本发明旨在解决目前基因精确敲除中长片段敲除的难度大、周期长的问题。首先确定5’sgRNA靶位点位于起始密码子附近(100bp以内),3’端sgRNA靶位点位于5’端sgRNA靶位点与终止密码子之间任何位置,sgRNA靶位点的编辑效率分数高并且脱靶效应接近于0;其次确定被删除序列的5’和3’端点位于5’sgRNA靶序列和3’sgRNA靶序列中,修复模板带有终止密码子。最后将5’端上游sgRNA质粒和3’端下游sgRNA质粒与所述Cas9质粒、共编辑标记质粒、报告基因质粒和修复模板制得显微注射DNA混合液体系一起注入雌雄同体线虫体内,统计其基因编辑效率并验证筛选功能与全基因敲除法的一致性,发现本发明提供的技术方案基因编辑效率高、性价比好和成功率高的优点。
搜索关键词: 靶位点 终止密码子 质粒 基因 靶序列 除法 敲除 删除 报告基因质粒 修复 插入的基因 大片段基因 基因敲除法 起始密码子 标记质粒 基因工程 任何位置 显微注射 长片段 全基因 线虫 成功率 体内 验证 筛选 上游 统计 发现
【主权项】:
1.一种精确大片段基因删除结合终止密码子插入的基因敲除法,其特征在于,包括以下步骤:/n准备Cas9质粒、共编辑标记质粒、报告基因质粒和雌雄同体线虫;/n确定5’和3’端sgRNA靶位点序列;/n确定和构建修复模板;/n构建5’端上游sgRNA质粒和3’端下游sgRNA质粒;/n配制显微注射DNA混合液:将所述5’端上游sgRNA质粒和3’端下游sgRNA质粒、所述Cas9质粒、共编辑标记质粒、报告基因质粒和修复模板混合得到所述显微注射DNA混合液;/n显微注射:将所述显微注射DNA混合液注射入雌雄同体线虫的性腺,得到P0代线虫,培养得到F1代线虫;以及/n筛选、验证目的突变。/n
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