[发明专利]一种与青稞条纹病相关的miRNAs及其挖掘方法在审
| 申请号： | 201910913916.9 | 申请日： | 2019-09-25 |
| 公开（公告）号： | CN110564813A | 公开（公告）日： | 2019-12-13 |
| 发明（设计）人： | 姚晓华;吴昆仑;姚有华;王越;苏乐平;侯璐;白羿雄 | 申请（专利权）人： | 青海大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6809 | 分类号： | C12Q1/6809;C12N15/113;G16B50/30;G16B40/00;G16B30/10 |
| 代理公司： | 61200 西安通大专利代理有限责任公司 | 代理人： | 张海平 |
| 地址： | 810016 青*** | 国省代码： | 青海;63 |
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| 摘要： | 本发明提供一种与青稞条纹病相关的miRNAs及其挖掘方法，通过从青稞条纹病叶上分离纯化青稞条纹病菌株，构建实验室条纹病病原菌侵染体系，采集发病和未发病的幼叶，进行高通量测序(miRNA‑seq)，构建了青稞miRNA的数据库，通过与miRBase 22、PMRD、mRNA/EST和rRNAetc数据库进行比对，挖掘出与青稞条纹病相关的miRNAs。 | ||
| 搜索关键词： | 条纹病 构建 病原菌 数据库 高通量测序 分离纯化 挖掘 条纹 比对 侵染 幼叶 病菌 采集 | ||
【主权项】：
1.一种与青稞条纹病相关的miRNAs的挖掘方法，其特征在于，包括如下步骤：/n步骤1，采集感染条纹病的青稞叶片；/n步骤2，条纹病病原菌侵染体系的构建/n步骤2.1，对感染条纹病的青稞叶片进行培养并分离获取青稞条纹病病原菌；/n步骤2.2，用青稞条纹病病原菌侵染条纹病高感青稞品种和条纹病高抗青稞品种的种子，然后进行培育；/n步骤3，待步骤2.2中青稞叶片长出且感病后，采集条纹病高感青稞品种和条纹病高抗青稞品种的感病和未感病叶片，分别提取总RNA，构建Small RNA文库，并进行miRNA高通量测序；/n步骤4，条纹病相关miRNA挖掘/n根据miRNA高通量测序结果，以青稞基因组为参考，通过与miRBase22、PMRD、mRNA/EST和rRNAetc数据库进行比对，分析条纹病高感青稞品种和条纹病高抗青稞品种感病前后miRNA的差异，得出差异miRNAs，再通过表达量差异筛选出与青稞条纹病相关的miRNAs。/n
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