[发明专利]EGFR基因突变检测用组合物及检测方法在审

专利信息
申请号: 201910925527.8 申请日: 2019-09-27
公开(公告)号: CN110541033A 公开(公告)日: 2019-12-06
发明(设计)人: 赵雨航;王书芳;葛志琪;何辉煌;李锦 申请(专利权)人: 迈克生物股份有限公司
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12Q1/6858;C12N15/11
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 611731 四*** 国省代码: 四川;51
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摘要: 发明公开一种高灵敏度的EGFR基因突变的检测用引物组合物及其检测方法。该引物组合物包括两条上游引物、探针和下游引物,其中第一条上游引物仅部分与靶序列互补配对,第二条上游引物及探针的序列分别与第一条上游引物上未与靶序列互补配对的部分序列相同。本发明的检测方法采用了数字PCR的方法,在进行常规数字PCR反应前对样本进行解链成单链的预处理。利用本发明的引物组合物及检测方法,可提高EGFR基因突变的检测灵敏度、特异性、降低检测成本;本发明的引物组合物及检测方法适用范围广、对样本中DNA含量要求极低。
搜索关键词: 引物组合物 上游引物 检测 互补配对 靶序列 探针 突变 样本 预处理 检测灵敏度 常规数字 高灵敏度 含量要求 下游引物 数字PCR 成单链 解链
【主权项】:
1.一种EGFR基因突变的检测用引物组合物,其特征在于:该引物组合物包括突变型引物组合物和/或野生型引物组合物;/n所述突变型引物组合物包括上游引物F1、上游引物F1-1、水解探针P1和下游引物,/n其中,所述上游引物F1从5’端至3’端依次包括上游检测区和靶序列结合区:/n(1)上游检测区从5’端至3’端包括:与F1-1具有相同序列的(a)部分,以及与水解探针P1具有相同序列的(b)部分,及/n(2)靶序列结合区的3’端具有扩增决定位点,所述扩增决定位点与突变型靶序列上的变异检测位点互补,且扩增决定位点的上游具有由一个或多个碱基组成的不与靶序列互补的错配区;/n所述野生型引物组合物包括上游引物F2、上游引物F2-1、水解探针P2和下游引物;/n其中,所述上游引物F2从5’端至3’端依次包括上游检测区和靶序列结合区:/n(1)上游检测区从5’端至3’端包括:与F2-1具有相同序列的(a)部分,以及与水解探针P2具有相同序列的(b)部分,及/n(2)靶序列结合区的3’端具有扩增决定位点,所述扩增决定位点与野生型靶序列上的变异检测位点互补,且扩增决定位点的上游具有由一个或多个碱基组成的不与靶序列互补的错配区。/n
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