[发明专利]基于游离DNA甲基化或羟甲基化差异的主动脉夹层检测方法及系统在审

专利信息
申请号: 201911040573.6 申请日: 2019-10-29
公开(公告)号: CN110684836A 公开(公告)日: 2020-01-14
发明(设计)人: 刘贇;刘佩茹;邱文青;杜多;张丹丹 申请(专利权)人: 复旦大学
主分类号: C12Q1/6883 分类号: C12Q1/6883;C12N15/11
代理公司: 31200 上海正旦专利代理有限公司 代理人: 陆飞;陆尤
地址: 200433 *** 国省代码: 上海;31
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摘要: 发明属于生物医学技术领域,具体为基于游离DNA甲基化或羟甲基化差异的主动脉夹层检测方法及系统。本发明方法包括:(一)游离DNA甲基化或羟甲基化差异检测,包括:整体甲基化或羟甲基化水平有统计学差异;特定位点或区域甲基化或羟甲基化水平有统计学差异;在基因组中的分布规律差异;(二)根据DNA甲基化或羟甲基化差异判别主动脉夹层是否发生。本发明系统包括游离DNA甲基化或羟甲基化差异检测模块和主动脉夹层发生判别模块。本发明取材方便,处理简单,避免繁复的手术取材;以DNA甲基化或DNA羟甲基化作为检测标准,这种化学修饰具有稳定的组织特异性,能明确反映组织来源和状态,检测结果稳定可靠。
搜索关键词: 羟甲基化 甲基化 主动脉夹层 游离DNA 统计学差异 取材 差异检测模块 生物医学技术 组织特异性 差异检测 分布规律 化学修饰 检测结果 判别模块 基因组 检测 位点
【主权项】:
1. 一种基于游离DNA甲基化或羟甲基化差异的主动脉夹层检测方法,其特征在于,利用游离DNA甲基化或DNA羟甲基化差异作为检测分子标记,具体步骤为:/n(一)游离DNA甲基化或羟甲基化差异检测/n收集主动脉夹层患者、正常人和其他病人游离DNA的甲基化或羟甲基化数据;/n(1)检测主动脉夹层病人和正常人或其他病人血液游离DNA的整体甲基化或羟甲基化水平有统计学差异(t检验,p<0.1);/n(2)检测主动脉夹层病人和正常人或其他病人血液游离DNA的特定位点或区域甲基化或羟甲基化水平有统计学差异(t检验,p<0.1);/n(3)检测主动脉夹层病人和正常人或其他病人血液游离DNA甲基化或羟甲基化在基因组中的分布规律差异;/n(二)根据DNA甲基化或羟甲基化差异检测主动脉夹层的发生/n(1)选择步骤(一)中差异(1)-(3)中的一种为判断分子标记,根据已有的主动脉夹层患者,正常人及其他病人游离DNA的甲基化或羟甲基化数据,建立分类模型,或者拟定正常值参考范围;/n(2)对于由DNA甲基化或DNA羟甲基化检测技术得到的待检测样品DNA甲基化或羟甲基化数据,根据上述建立的分类模型或拟定的正常值范围,判断主动脉夹层是否发生。/n
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