[发明专利]一种检测细胞内基因编辑效率及脱靶的方法在审
| 申请号： | 201911324596.X | 申请日： | 2019-12-20 |
| 公开（公告）号： | CN113005185A | 公开（公告）日： | 2021-06-22 |
| 发明（设计）人： | 罗永伦;渠坤丽;向熙 | 申请（专利权）人： | 青岛华大基因研究院 |
| 主分类号： | C12Q1/6869 | 分类号： | C12Q1/6869 |
| 代理公司： | 深圳鼎合诚知识产权代理有限公司 44281 | 代理人： | 彭家恩;罗瑶 |
| 地址： | 266000 山东省青岛市*** | 国省代码： | 山东;37 |
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| 摘要： | 一种检测细胞内基因编辑效率及脱靶的方法，包括：构建TRAP‑seq序列，其包括从5’端至3’端依次连接的上游接头序列、gRNA序列、gRNA骨架序列、gRNA靶向序列和下游接头序列；使用设计在上游接头序列和下游接头序列上的引物，对TRAP‑seq序列进行PCR扩增得到双链TRAP‑seq序列；将双链TRAP‑seq序列连接到质粒骨架上，得到重组TRAP‑seq序列质粒库；对重组TRAP‑seq序列质粒库进行慢病毒包装，并感染宿主细胞株；从被感染的宿主细胞株中提取细胞基因组，然后使用设计在质粒骨架上的引物扩增细胞基因组获得TRAP‑seq序列，然后测序并分析测序数据得到基因编辑效率及脱靶情况。本发明能高通量检测基因编辑效率及脱靶，只需扩增子测序即可获得所需数据量，避免了全基因组测序带来的资源浪费。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 检测 细胞内 基因 编辑 效率 脱靶 方法 | ||
【主权项】：
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