[发明专利]一种交互式细胞异质性分析可视化平台及其实现方法在审

专利信息
申请号: 202010015062.5 申请日: 2020-01-07
公开(公告)号: CN111243675A 公开(公告)日: 2020-06-05
发明(设计)人: 周煌凯;夏昊强;张羽;陶勇;罗玥;张秋雪 申请(专利权)人: 广州基迪奥生物科技有限公司
主分类号: G16B40/00 分类号: G16B40/00;G16B45/00;G06K9/62
代理公司: 广州三环专利商标代理有限公司 44202 代理人: 郭浩辉;麦小婵
地址: 510000 广东省广州市广州国*** 国省代码: 广东;44
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摘要: 发明公开了一种交互式细胞异质性分析可视化平台及方法,所述平台包括:细胞亚群分类分析模块,用于接收用户上传的数据,利用R包Seurat降维,并将转录本信息相似的单细胞聚类分群,将样本分为若干个细胞亚群,进行可视化展示;亚群marker基因分析模块,用于利用R包Seurat调用平台分析程序可视化展示有效基因在不同细胞亚群的表达情况,获得marker基因在各细胞亚群的表达情况,并进行可视化展示,以用于细胞亚群鉴定;亚群上调基因分析模块,用于利用R包Seurat调用平台分析程序获取亚群上调基因分布表格,并调用平台分析程序展示亚群上调基因在细胞亚群的分布情况。
搜索关键词: 一种 交互式 细胞 异质性 分析 可视化 平台 及其 实现 方法
【主权项】:
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