[发明专利]确定核酸样本中CNV的方法、装置及应用有效

专利信息
申请号: 202010261297.2 申请日: 2020-04-03
公开(公告)号: CN113496761B 公开(公告)日: 2023-09-19
发明(设计)人: 王泰福;周青;孙井花;王文婧 申请(专利权)人: 深圳华大生命科学研究院
主分类号: G16B30/10 分类号: G16B30/10;G16B35/00;G06N20/00;G06N3/006
代理公司: 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 代理人: 张立
地址: 518083 广东*** 国省代码: 广东;44
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摘要: 发明涉及基因测序领域,具体涉及一种确定核酸样本中CNV的方法、装置及应用。所提供的方法包括:(1)获取核酸样本的测序数据;(2)基于测序数据,利用CNV检测软件,确定由多个初始CNV构成的初始CNV集合;(3)针对每个初始CNV,确定分类特征;(4)基于每个初始CNV的分类特征,利用预先构建的机器学习模型,对所述初始CNV集合进行筛选,以便获得最终CNV集合,所述分类特征为测序深度、GC含量、CNV类型、长度等多个特征中的至少一种。引入机器学习模型,并基于不同分类特征对初始CNV集合进行筛选,能够很好的排除人工筛选所引入的误差。而且只需要使用单个软件检测即可,最大程度保留了真实的CNV。
搜索关键词: 确定 核酸 样本 cnv 方法 装置 应用
【主权项】:
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