[发明专利]适用于PacBio测序平台的原核全长初始转录本建库方法及应用在审
申请号: | 202010275291.0 | 申请日: | 2020-04-09 |
公开(公告)号: | CN111440845A | 公开(公告)日: | 2020-07-24 |
发明(设计)人: | 方涛 | 申请(专利权)人: | 嘉兴菲沙基因信息有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806;C12N15/10;C40B50/06 |
代理公司: | 上海精晟知识产权代理有限公司 31253 | 代理人: | 周琼 |
地址: | 314000 浙江省嘉兴市*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | 本发明提供一种适用于PacBio测序平台的原核全长初始转录本建库方法及应用,包括:依次在原核生物总RNA的3’末端加尾、5’末端添加生物素标记帽子,然后捕获带有生物素标记的初始转录本,最后合成初始转录本全长cDNA并构建其PacBio文库。该方法在原核转录组的3’末端加尾作为cDNA全长扩增一链合成的引物位点,实现了原核生物进行全长转录组测序,扩大了全长转录组测序技术的适用范围。同时,在初始转录本5’末端添加生物素标记的帽子,然后富集目标全长初始转录本,从而去除总RNA中的rRNA,极大的提高了数据有效率;合成全长cDNA时,在第一条链的末端添加额外核苷酸序列作为第二链引物的结合位点,避免SMARTer技术的偏好性问题,使测序更加均一。 | ||
搜索关键词: | 适用于 pacbio 平台 全长 初始 转录 方法 应用 | ||
【主权项】:
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