[发明专利]一种模型非依赖的基因组结构变异检测系统及方法有效

专利信息
申请号: 202010313833.9 申请日: 2020-04-20
公开(公告)号: CN111583996B 公开(公告)日: 2023-03-28
发明(设计)人: 叶凯;蔺佳栋;杨晓飞;徐暾 申请(专利权)人: 西安交通大学
主分类号: G16B20/20 分类号: G16B20/20;G16B40/00
代理公司: 西安通大专利代理有限责任公司 61200 代理人: 马贵香
地址: 710049 *** 国省代码: 陕西;61
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摘要: 发明提供一种模型非依赖的基因组结构变异检测系统及方法,以模型非依赖结构变异检测理论为核心,通过变异信号提取模块、频繁最大子图挖掘模块和分类模块,实现了不依靠任何变异模型的结构变异检测。频繁变异模式挖掘模块正是抓住了结构变异遗留在基因组上的特征,仅仅通过挖掘大量正常数据中的异常点来判断潜在结构变异区域;其次,根据不同变异类型扰动基因组的方式不同,进而导致变异信号的不同排列顺序,基于此结合具有记忆功能的深度学习模型对不同变异类型进行分类。本发明不依靠任何变异模型,因此变异的检测灵敏度和错误率大大降低,并且适用于复杂变异类型的检测,不需要建立额外的结构变异模型。
搜索关键词: 一种 模型 依赖 基因组 结构 变异 检测 系统 方法
【主权项】:
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