[发明专利]拷贝数变异的检测方法和装置有效
申请号: | 202010403942.X | 申请日: | 2020-05-13 |
公开(公告)号: | CN111599407B | 公开(公告)日: | 2021-10-15 |
发明(设计)人: | 曹善柏;王文平;张萌萌;郭璟;楼峰 | 申请(专利权)人: | 北京橡鑫生物科技有限公司;天津橡鑫生物科技有限公司;北京橡鑫医学科技有限公司 |
主分类号: | G16B20/10 | 分类号: | G16B20/10;G16B20/30 |
代理公司: | 北京康信知识产权代理有限责任公司 11240 | 代理人: | 路秀丽 |
地址: | 100080 北京市*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本发明提供了一种拷贝数变异的检测方法和装置。该检测方法包括:获取待测样本的测序比对数据;计算测序比对数据中每个碱基位点的测序深度;将参考基因组划分为多个bin的方式,利用每个碱基位点的测序深度,计算待测样本的每个bin的拷贝数;合并拷贝数与指定contig的倍性不同的bin,得到发生胚系拷贝数变异的区域。该方面能够检测出长度超过1000bp的基因外显子的缺失或重复,与现有技术中的芯片方法相比,该方法检测CNV具有更高的覆盖度、分辨率及更准确的拷贝数评估,不仅能够检测某些已知位点的拷贝数变异情况,而且可以检测未知的拷贝数变异情况,提高检测的灵敏度。 | ||
搜索关键词: | 拷贝 变异 检测 方法 装置 | ||
【主权项】:
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