[发明专利]一种基于注意力机制的CRISPR/Cas9脱靶预测方法在审
| 申请号： | 202010433848.9 | 申请日： | 2020-05-21 |
| 公开（公告）号： | CN111613267A | 公开（公告）日： | 2020-09-01 |
| 发明（设计）人： | 曾甜;戴宪华 | 申请（专利权）人： | 中山大学 |
| 主分类号： | G16B15/30 | 分类号： | G16B15/30;G16B30/00;G16B40/00 |
| 代理公司： | 暂无信息 | 代理人： | 暂无信息 |
| 地址： | 510275 广东*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明涉及一种基于注意力机制的CRISPR/Cas9脱靶预测方法，涉及基因编辑领域，该方法包括：构建脱靶数据集、sgRNA‑DNA序列对编码、搭建脱靶预测模型、训练模型权重及利用训练好的模型预测sgRNA‑DNA序列对是否包含脱靶位点。本发明通过分析sgRNA‑DNA序列对的组成及匹配情况与其脱靶问题之间的关系，提出了一种新的基于注意力机制的CRISPR/Cas9脱靶预测模型，该模型以三层卷积神经网络作为基框架，引入注意力机制用以提取sgRNA‑DNA序列对内与位置信息相关的特征。此模型能够提取到丰富的与sgRNA‑DNA脱阿不问题相关的特征，相比现有的预测算法能够更加准确全面的预测CRISPR/Cas9的脱靶问题，且具有更好的泛化性能。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 注意力 机制 crispr cas9 脱靶 预测 方法 | ||
【主权项】：
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