[发明专利]甲基化水平的向量化表征、特定测序区间检测方法和装置有效

专利信息
申请号: 202010462199.5 申请日: 2020-05-27
公开(公告)号: CN111627499B 公开(公告)日: 2020-12-08
发明(设计)人: 杨昊;蒋泽宇 申请(专利权)人: 广州市基准医疗有限责任公司
主分类号: G16B25/10 分类号: G16B25/10;G16B20/30
代理公司: 广州广典知识产权代理事务所(普通合伙) 44365 代理人: 万志香
地址: 510000 广东省广*** 国省代码: 广东;44
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摘要: 本申请涉及一种甲基化水平的向量化表征、特定测序区间的检测、特定测序区间的记录方法、装置、计算机设备和可读存储介质。其中甲基化水平的向量化表征方法和装置,可以通过获取样本的甲基化信息,确定阅读区间各类测序结果的Reads数目,将滑动窗口在阅读区间按照滑动步长从滑动,以获取各次窗口读取过程中,滑动窗口的各个序列组合的出现次数,进而确定各个甲基化测序区间在各次窗口读取过程的次数向量,将各个次数向量拼接为相应甲基化测序区间的甲基化向量,使所确定的甲基化向量中的每个向量元素与检测样本中各个甲基化测序区间的序列组合一一对应,能够对检测样本中各个甲基化测序区间的甲基化信息进行全面表征。
搜索关键词: 甲基化 水平 量化 表征 特定 区间 检测 方法 装置
【主权项】:
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