[发明专利]一种基于核心基因组SNP分析的副溶血性弧菌溯源方法在审
| 申请号： | 202010551662.3 | 申请日： | 2020-06-16 |
| 公开（公告）号： | CN111724859A | 公开（公告）日： | 2020-09-29 |
| 发明（设计）人： | 庞锐;吴清平;吴诗;张菊梅;黎艳萍;雷涛;陈谋通;张淑红;杨小鹃;叶青华 | 申请（专利权）人： | 广东省微生物研究所（广东省微生物分析检测中心） |
| 主分类号： | G16B30/00 | 分类号： | G16B30/00;G16B50/00 |
| 代理公司： | 广州三环专利商标代理有限公司 44202 | 代理人： | 郝传鑫 |
| 地址： | 510070 广东省广州*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种基于核心基因组SNP分析的副溶血性弧菌溯源方法，所述方法对研究样品菌株和参考菌株核心基因组的SNP进行分析，判断其与各参考菌株之间的双尾SNP距离，可得到样品菌株与参考菌株之间的溯源关系，并可进一步用于样品菌致病性研究。本发明的副溶血性弧菌菌株溯源方法，可精确地反映样品菌与已知参考菌之间的分化时间，能较好地解释不同菌株之间的克隆性。相对于传统的分型方法，本发明方法通量更高，分辨率、准确性和重复性都更好，有助于确定不同菌株之间是否存在直接传播关系，对于不同菌株的流行病学关联研究、疾病防控具有重要的意义。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 核心 基因组 snp 分析 溶血 弧菌 溯源 方法 | ||
【主权项】：
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