[发明专利]冰冻植物组织Hi-C建库的方法在审
申请号: | 202010821338.9 | 申请日: | 2020-08-14 |
公开(公告)号: | CN111808927A | 公开(公告)日: | 2020-10-23 |
发明(设计)人: | 李彪;郭松;仉旭;沈世超 | 申请(专利权)人: | 天津诺禾致源生物信息科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806;C12N15/10;C40B50/06 |
代理公司: | 北京康信知识产权代理有限责任公司 11240 | 代理人: | 梁文惠 |
地址: | 301700 天津市*** | 国省代码: | 天津;12 |
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摘要: | 本发明公开了一种冰冻植物组织Hi‑C建库的方法。该方法包括以下步骤:S1,冰冻植物组织液氮研磨;S2,加入甲醛进行固定,加入甘氨酸进行终止固定;S3,过细胞筛网;S4,将固定化的细胞进行细胞裂解,然后进行限制性内切酶消化;S5,进行标记物标记,并平末端化;S6,重新连接;S7,解除固定化,进行DNA片段的提取,回收DNA片段;S8,去除带有标记物标记但未连接的DNA片段;S9,DNA打断;S10,钓取含有标记物标记的DNA片段;S11,末端修复加接头;S12,PCR扩增,获得Hi‑C文库。应用本发明的建库的方法,利用冰冻植物组织进行Hi‑C建库,可以达到与新鲜叶片Hi‑C建库同等的有效数据率。 | ||
搜索关键词: | 冰冻 植物 组织 hi 方法 | ||
【主权项】:
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